柯南在從大阪回來的新干線中遇上了佐藤警官、高木警官。兩人正在押送毒品的秘密販賣者小倉。途中車內發現可疑的炸彈包裹。就在佐藤前去查看之時留下高木警官的時候，犯人小倉要求去廁所，卻在廁所中用刀刺自己的腹部身亡。而在調查的過程中佐藤發現小倉血跡的疑點，并推斷出這是他殺時間而非自殺。

小五郎等人代替園子的父親鈴木史郎出席茶會。茶會舉辦的公館里有著可以變化五種顏色的池塘，池子正中建有由渡廊連接的茶室五彩庵。在等待的過程中眾人聽說了魔物的傳說。終于見到宗師青野木之后卻意外聽到這是他泡的最后一壺茶的宣言。在第二天眾人再次來到在這個有五彩傳說的茶室的時候卻意外發現青野木家的一家之長上吊身亡。

小五郎受堂本觀光社長堂本榮造之邀，來到天部山參加空中纜車的開幕典禮，雖然有傳言說只要靠近天女像就會遭到詛咒，可堂本觀光卻執意在神像的附近開通了觀光纜車。開幕會結束之后，所有來賓都試搭乘纜車，當纜車行駛到神像內部的隧道時，車內突然停電漆黑一片，只能聽到榮造的慘叫，待纜車駛出隧道，大家發現榮造居然在這間密室般的纜車中消失了，之后他的女兒里菜在神像的手掌上發現了他的尸體。

少年偵探隊本來是跟著阿笠博士一起出來露營，沒想到居然在森林中發現了一個鐘乳石洞穴，柯南四人立刻進洞探險，卻在這里碰到了一伙兒搬運尸體的歹徒，而柯南為了掩護大家逃跑中彈受傷，之后，便血流不止，元太背著柯南尋找出口，可身后的歹徒也循著聲音疾步追來，失去了柯南的指引，少年偵探團剩下的三人會采取什么樣的行動？

高木剛說完十八年的搶匪就在佐藤正義警官的四位老友之中后，便突然失去了音訊，按照柯南的建議，佐藤警官急忙趕到他們四人所去的酒屋，卻發現他們早已離開，根據老板的供詞柯南推理出了誰是當年的歹徒，他告訴佐藤后，讓她自己去了結這宗案件。另一邊，步美等人私自跟蹤縱火犯遇到危險，幸虧柯南及時趕到才得以獲救，而這名縱火犯也被警方逮捕。