大筒木一族三人突襲中忍考試會場，目的是回收鳴人的尾獸查克拉重新種植神樹，煉制長生不老的丹藥。佐良娜險些被大筒木金武襲擊，佐助登場救女兒。鳴人被大筒木桃式一腳踢飛，博人用科學忍具接連反擊，力量卻被對方吸收據為已用。鳴人開啟九尾模式對抗大筒木，他守護村子的身影感化了博人。

最近一連串的事件牽扯出了根的殘黨，佐井在秘密研究所找到了線索。與此同時，早已清楚真正犯人是誰的巳月向博人透漏了消息，但博人卻怎么也不愿相信，因為操縱暗影的竟然是他們的班長堇。在遭到佐井抓捕時堇召喚出了鵺，狂暴的鵺勢必會給村子帶來災難性的打擊，巳月接到的任務是殺掉堇從而停止鵺的活動，面對這種局面博人又會做出怎樣的選擇？

覬覦地球的大筒木一族已經開始了行動，而毫不知情的忍者世界還在如火如荼的準備中忍考試，這次的中忍考試將由五大忍者村聯合舉辦，在眾人都積極準備的時候博人卻提不起興趣。向日葵的生日當天忙碌的鳴人只能派分身回家，體力不支的他搞砸了向日葵的生日派對，一旁的博人非常氣憤。

白夜團利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學忍具研究所。當大家的注意力全被雷門公司吸引時白夜團搶走了研究所的忍術資料，鹿臺意識到這一點后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團，在同伴們的掩護下鹿臺和博人追了上去，他們能阻止白夜團的陰謀嗎？

霧隱村修學旅行告一段落，博人興高采烈的和家人講述在霧影村發生的事情，但一旁的向日葵卻不怎么高興。在媽媽的提示下博人才想起臨走前的承諾，他將要給向日葵帶土產的事情忘的一干二凈，看到妹妹失望的表情后博人四處求助一起旅行回來的同學，就在他碰壁沮喪時佐良娜說出了一家賣土產“水八橋”的店。