被害的真紀(jì)的因?yàn)殄X(qián)包不見(jiàn)了，被疑為是強(qiáng)盜殺人。乍看之下雖然像是強(qiáng)盜殺人，柯南卻肯定兇手是這些大學(xué)生一行人中的某人。雖然懷疑藤浩的不在場(chǎng)證明是否可以確立，這時(shí)這一行人中復(fù)雜的人際關(guān)系一點(diǎn)一點(diǎn)浮現(xiàn)出來(lái)。這次的殺人事件中，隱藏著另外一個(gè)邪惡的計(jì)劃。在“沉睡的小五郎”的解說(shuō)下兇手最終浮出水面來(lái)。

服部收到了一封古怪的委托信，于是，他們一行人便來(lái)到了美國(guó)島，沒(méi)想到這封信的寄件人紗織卻在三天前失去了蹤影，當(dāng)晚，島上熱烈的慶祝一年一度的儒艮慶典活動(dòng)，傳說(shuō)有位吃過(guò)人魚(yú)肉的長(zhǎng)壽婆，任何人只要拿到她念過(guò)咒的儒艮之箭，就能實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)生不老的美夢(mèng)，但就在慶典進(jìn)行期間，沙織的朋友壽美竟然被人發(fā)現(xiàn)勒死在瀑布上，服部和柯南認(rèn)為這是一起殺人事件并著手進(jìn)行調(diào)查，然而在為壽美守靈的晚上又發(fā)生了一件慘案。

大家小心翼翼的吃完晚餐后，這具代替主人的假人偶再次開(kāi)口并講述了四十年前在這棟別墅中所發(fā)生的慘案，而他的目的則是讓悲劇重演，這時(shí)，大上祝善當(dāng)著大家的面中毒死亡，而和小五郎、茂木一起開(kāi)車(chē)去察看吊橋狀況的千間也因車(chē)子爆炸而生死未卜，返回別墅之后，柯南、小五郎和茂木在鋼琴房中發(fā)現(xiàn)了很多線索，然而卻突然響起了槍聲，三人趕到時(shí)，白馬探已經(jīng)死亡，隨后，槍田郁美的尸體也在電腦房被發(fā)現(xiàn)。

小五郎的車(chē)子出了故障，求助于偶爾路過(guò)的橘律師。因?yàn)檐?chē)子一時(shí)之間修不好，便到了橘律師的別墅。橘律師因?yàn)樨澪凼录喈?dāng)出名。突然小蘭發(fā)現(xiàn)出海的橘律師的船翻船，橘律師死亡，而柯南也發(fā)現(xiàn)原本橘律師身上的救身衣不翼而飛。而橘律師最近收到一個(gè)化名“T.K”的恐嚇信。名字縮寫(xiě)為T(mén).K的熊田達(dá)也的嫌疑劇增。

正當(dāng)少年偵探團(tuán)在西多摩郡龍神山游玩之時(shí)，突然從山上墜落一輛汽車(chē)。雖然看似事故，在柯南的提示下警方判斷這個(gè)事件不是事故而是謀殺。光彥偷偷的從事故現(xiàn)場(chǎng)拿到寫(xiě)著暗語(yǔ)的紙條。從寫(xiě)著暗號(hào)的紙片入手，光彥，步美，元太3人一起來(lái)到了暗號(hào)所指示的地點(diǎn)，在這里他們發(fā)現(xiàn)了大量被盜的車(chē)輛和先前謀殺案的兇手。