毛利小五郎帶柯南和小蘭來(lái)高級(jí)餐廳用餐，進(jìn)門(mén)后三人發(fā)現(xiàn)桌上擺滿了食物卻沒(méi)有客人，并在廚房發(fā)現(xiàn)了倒在地上的廚師口石先生。清醒后的口石先生告訴三人，原本有五名客人在餐廳里用餐，不料自己在做飯時(shí)遭到了歹徒的襲擊，客人們也不知去向。毛利小五郎馬上通知了目暮警官，并查清了每個(gè)客人的身份，然而卻難以判斷消失的客人們?nèi)チ撕翁帯Ｕ谶@時(shí)，擺放在餐桌上的甜點(diǎn)和雜物引起了柯南的注意。

米小圈在電視上看到小區(qū)大娘的寵物狗丟了，看來(lái)小區(qū)附近有偷狗賊，米小圈非常驚慌地跑出去看耗子，剛好姜小牙也在，姜小牙總是來(lái)看耗子，現(xiàn)在不會(huì)再偷偷將它帶回家了，鐵頭也看了電視，匆匆忙忙來(lái)找耗子，三個(gè)人都這么關(guān)心寵物狗，鐵頭聽(tīng)到米小圈同意他作孩子的哥哥，起初還很開(kāi)心，當(dāng)聽(tīng)到姜小牙和米小圈都作了耗子的爸爸時(shí)，頓時(shí)不開(kāi)心了，三個(gè)人的關(guān)系這么鐵，現(xiàn)在直接差輩了。三個(gè)人正說(shuō)著，忽然發(fā)現(xiàn)狗沒(méi)了，之后匆匆忙忙去找狗，卻在小區(qū)另一側(cè)，中央公園門(mén)口一個(gè)老大爺騎車帶著耗子悠閑而去。米小圈和姜小牙鐵頭就這樣看著耗子被帶走，他們立刻給警察叔叔報(bào)了警，之后尾隨狗販子看要將狗帶去哪里。他們一路跟著到了一處小院，親眼看到耗子被關(guān)了進(jìn)去，米小圈和姜小牙和鐵頭商量采用聲東擊西的方法引開(kāi)爺爺，之后再偷偷潛入院子將耗子偷走。鐵頭哭不出來(lái)，姜小牙便幫忙在他大腿處狠狠掐了一把，終于鐵頭疼得哇哇大哭。鐵頭哭著稱自己找不到家，老大爺便帶著他去找家，米小圈和姜小牙便悄悄溜進(jìn)院子，將耗子給抱了起來(lái)，姜小牙被一盆粉紅色的面團(tuán)吸引，伸手去捏了捏，竟然整雙手都被陷了過(guò)去，米小圈趕過(guò)去幫忙，兩人都被面團(tuán)黏住了。就這樣錯(cuò)過(guò)了偷跑的最佳時(shí)機(jī)，不一會(huì)兒

為了紀(jì)念戰(zhàn)國(guó)武將信長(zhǎng)入主岐阜城450周年，偵探少年團(tuán)和阿笠博士來(lái)到岐阜市內(nèi)游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當(dāng)?shù)氐挠⑿坌惚硌荨１硌萁Y(jié)束后，光彥因想得到簽名而獨(dú)自返回觀看場(chǎng)所，然而他卻在尋找表演人員的過(guò)程中遭到綁架……與此同時(shí)，在博物館展出的信長(zhǎng)公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

高木警官突然來(lái)電要找柯南，他說(shuō)柯南是殺人事件的知情人。畫(huà)家北園青峰下午三點(diǎn)半左右在家被人殺害， 警方為了確定嫌疑人之一北園先生的弟子西山大樹(shù)的不在場(chǎng)證明把柯南叫來(lái)，因?yàn)槭掳l(fā)當(dāng)日西山將柯南和朋友們作為模特畫(huà)了一幅風(fēng)景畫(huà)。北園先生的兩位弟子和妻子都似乎與北園先生有過(guò)糾紛，這次的案件讓警察們陷入困局。

毛利小五郎受久須美工械廠社長(zhǎng)的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉(cāng)庫(kù)抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。