與黑色組織面對(duì)面 滿(mǎn)月之夜的兩起神秘事件(之二)灰原一人在家等新出醫(yī)生接她看病的時(shí)候，茱蒂老師居然出現(xiàn)在門(mén)外。另一邊，幽靈船上的宴會(huì)剛開(kāi)始，船長(zhǎng)就被不明人士用十字弓射殺，而在他的胸前還出現(xiàn)了一張惡魔牌，在對(duì)工作人員進(jìn)行詢(xún)問(wèn)之后，小五郎認(rèn)為兇手就是與自己一組的但將惡魔牌遺失的木乃伊，以此同時(shí)，和小五郎同組的隱形人獨(dú)自一人展開(kāi)了調(diào)查，并且還發(fā)現(xiàn)了不少線(xiàn)索，他利用廣播將船艙內(nèi)的客人叫的甲板，在揭秘兇手及其犯案手法之前，他拆掉了自己的偽裝……

少年偵探隊(duì)在調(diào)查連續(xù)闖空門(mén)事件的時(shí)候，一幢公寓里突然傳出女聲尖叫，原來(lái)這名叫細(xì)野的小姐在買(mǎi)回來(lái)的二手沙發(fā)里發(fā)現(xiàn)了一具女尸，警方懷疑是她就是兇手，但細(xì)野卻有不在場(chǎng)的證明，這時(shí)，她的鄰居德永先生剛好回來(lái)，他說(shuō)昨天聽(tīng)到細(xì)野房中有爭(zhēng)執(zhí)的聲音，為搜集更多線(xiàn)索，高木去了那家二手家具店調(diào)查，得知那個(gè)沙發(fā)其實(shí)是從細(xì)野家附近的垃圾堆撿到的，一切又回到原點(diǎn)，就在大家一籌莫展時(shí)，光彥說(shuō)他知道誰(shuí)是兇手……

朱蒂準(zhǔn)備辭去學(xué)校英語(yǔ)老師工作回美國(guó)。小蘭和園子為朱蒂舉辦了送別晚會(huì)，在去找中學(xué)同學(xué)七川的時(shí)候卻發(fā)現(xiàn)她正被打工的便利店里的訓(xùn)斥。為了洗清朋友小偷的嫌疑，小蘭她們開(kāi)始尋找沒(méi)有留下一點(diǎn)痕跡的小偷。但是從監(jiān)控錄像和店長(zhǎng)的證詞中都沒(méi)有小偷的蹤影，而店長(zhǎng)也準(zhǔn)備把七川送到警察局！

在電梯邊被殺的中條寫(xiě)下暗號(hào)『○×△』。還有一個(gè)文字是在殺害現(xiàn)場(chǎng)的電梯踏板邊的『□』。柯南從英語(yǔ)老師朱蒂的話(huà)中得到啟發(fā)，在調(diào)查死者的工作場(chǎng)所之后發(fā)現(xiàn)碎紙機(jī)的存在從而推理出死亡信息的真實(shí)意義。原來(lái)死亡信息很像是文字的部分，像記號(hào)般的文字。而在對(duì)照目暮警官拿著嫌疑犯的名單之后很快找到了兇手！

參加網(wǎng)球比賽的柯南他們來(lái)到熊本縣。市內(nèi)觀光的途中，園子撿到一部手機(jī)。手機(jī)的畫(huà)面上是“想要遇見(jiàn)那個(gè)孩子”的短信。園子與小蘭得到與園子同名女子的戀人的幫助，帶著手機(jī)出現(xiàn)在咖啡店。小蘭無(wú)意中聽(tīng)到兩人的危險(xiǎn)談話(huà)被綁架，而在小蘭打來(lái)的電話(huà)中柯南他們開(kāi)始進(jìn)行調(diào)查決心已定要組織這場(chǎng)謀殺！