打算盜取鈴木財閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜基德，想起了以前關于鐘臺的一個事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事務所里收到一封附有支票的不明發信人的信函，并且在其上方還有一行奇怪的話語。

雖然可以確定兇手就是大場先生，但是還有兩個疑點未能破解，就在新一深入調查的時候，他的身體突然一陣疼痛，藥物正在漸漸失效，他強忍住即將變小的身體所帶來的痛苦，堅持將案件的真相公諸于眾，案件完美解決之后，新一又變回了柯南，再次的突然離開，他將如何向小蘭解釋？

小五郎和蘭和柯南住進了建在山里的山莊。在那里住宿的客人中有“城市獵人”節目的演員砂岡和工作人員。小五郎和大家一起去燒烤，不久聽到了槍聲，砂岡被殺害了。經過調查每個人都有很充足的不在場證明，而調查證據也顯示兇手竟是從對面的懸崖開的槍?？履辖涍^分析后將兇手鎖定在三人之中。

被害的真紀的因為錢包不見了，被疑為是強盜殺人。乍看之下雖然像是強盜殺人，柯南卻肯定兇手是這些大學生一行人中的某人。雖然懷疑藤浩的不在場證明是否可以確立，這時這一行人中復雜的人際關系一點一點浮現出來。這次的殺人事件中，隱藏著另外一個邪惡的計劃。在“沉睡的小五郎”的解說下兇手最終浮出水面來。

受到服部的邀請，小五郎、小蘭和柯南前往大阪參加一個名為3K餐廳的開幕酒會，餐廳老板是前職業拳擊手里卡巴雷、美國職棒投手邁克諾德和柯南的偶像職業足球選手雷卡迪斯三人，沒有想到就在柯南等人協助他們進行一場秘密計劃的時候，槍聲突然響起，柯南和服部匆忙趕到發出槍聲的房間，發現美國報社記者埃德麥肯竟然被人槍殺橫尸屋內，警方立刻對所有來賓進行排查，另一邊服部發現柯南的表現很反常。