這個從天而降死亡的人是江源，但從領(lǐng)結(jié)和皮帶等細節(jié)可以看出暗夜公爵并不是江源，警察去江源房間搜查時，發(fā)現(xiàn)房門居然上有防盜鎖，兇手把江源推下后是怎么逃脫的？在警察對其他人偵訊時，暗夜公爵將看守江源尸體的空手道高手打昏，還出現(xiàn)在了柯南、小蘭和佐山面前，并完全躲開了小蘭攻擊，難道說兇手就是……

毛利蘭在網(wǎng)咖與委托人水谷雪乃視訊，雪乃表示遭到男友久保健介家暴與跟蹤，因為不知所措，所以找毛利小五郎商量。不過由於小五郎跑去看偶像演唱會，所以今天只好由小蘭跟她視訊連線。可是就在兩人連線途中，突然聽到用力敲門的聲音。雖然小蘭一直勸雪乃不要開門，可是雪乃還是受不了去開了門，後來雪乃從畫面中消失，只聽到她的求救尖叫聲。很擔(dān)心的小蘭馬上找新一到雪乃的公寓去，可是在那里卻只看到雪乃的血跡...

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時撿到了一張畫有奇怪符號的紙，大家自行成立少年偵探團去調(diào)查這些暗號，按照符號的指示先到達東京塔，在周圍展開偵查卻一無所獲，休息的時候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標(biāo)記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號嗎？暗中跟蹤少年偵探團的黑衣人又是誰？

園子邀請柯南和小蘭到家中別墅度假而富澤財閥的別墅也建在旁邊。當(dāng)晚別墅突然停電而向外看時，柯南眾人正好目擊到富澤的父親被殺害的現(xiàn)場，凌子看到兇手的樣子，犯人竟然是死者的兒子熊三！在警方逮捕熊三時發(fā)現(xiàn)剛剛到達的老大和老二和熊三面貌竟然一模一樣。但在柯南的調(diào)查下最終鎖定了犯人并已園子的身份揭露了犯人的身份。

步美某日經(jīng)過傳說中的鬼屋，而且還看到屋內(nèi)有鬼火！為了一探究竟柯南，步美，光彥還有元太一起出動來到這個傳說中的鬼屋。因為屋主被殺后家里的其他人就突然間不知去向，于是許多鬧鬼的傳說就此傳開。但在柯南和少年偵探團的各位探查之后發(fā)現(xiàn)了鬼屋中真的有人居住著！在調(diào)查了屋子之后柯南終于發(fā)現(xiàn)背后真正的秘密。最終殺害房子主人的兇手也自首承認罪行。