在東京的松陰神社，少年偵探團(tuán)及時(shí)救下了被男子襲擊的小早川公子小姐，為了尋找她爺爺藏起來(lái)的足以買下國(guó)家價(jià)值連城的寶藏，大伙一起前往她的老家津和野在中途的新山口車站，遇到了自稱是公子小姐的朋友川子茂先生，但柯南和灰原注意到這并非他的真名，到達(dá)之后，他們又發(fā)現(xiàn)了新的暗號(hào)，順著線索來(lái)到了萩市，沒(méi)想到襲擊公子小姐的人那些人將灰原、光彥和公子小姐帶走。

著名畫(huà)家及川武賴四部曲作品當(dāng)中的最后一幅《青嵐》被怪盜基德盯上，柯南、小五郎也因此被請(qǐng)到了及川府，然而那幅畫(huà)竟然在設(shè)有監(jiān)視器的畫(huà)室里瞬間消失不見(jiàn)，與此同時(shí)，及川的岳父風(fēng)景畫(huà)大師神原也被發(fā)現(xiàn)死在這個(gè)房間內(nèi)，難道兇手是從不殺人的基德？之后及川在柯南的后衣口袋中發(fā)現(xiàn)了基德留下的卡片，但柯南一眼就看穿了他的把戲，并推斷出基德就在四名警察之中。

電視臺(tái)要制作與小五郎24小時(shí)密切接觸的電視節(jié)目，為了討論節(jié)目?jī)?nèi)容，小五郎帶著柯南和小蘭隨節(jié)目制作公司的社長(zhǎng)染井彰吾一起前往東都電視臺(tái)制作人中目賴策的家中商討方案，沒(méi)想到大門竟然上了鎖而且按門鈴也沒(méi)有回應(yīng)，于是請(qǐng)來(lái)管理員打開(kāi)門進(jìn)入公寓，出現(xiàn)在他們眼前的是因喝下毒咖啡而身亡的中目的尸體，從在桌面和地面上打翻的咖啡痕跡，柯南看出這是一起密室殺人案。

兇器是房間工具箱里的錘頭，并且柯南還發(fā)現(xiàn)每個(gè)人的房間都有薰衣草和工具箱，到底是誰(shuí)做出這種安排？又是出于什么目的呢？既然是無(wú)人島，那么兇手一定就是這棟房子中的一人，之后柯南他們又對(duì)供電的小房子進(jìn)行了調(diào)查，然而根據(jù)所找的線索，柯南，服部和白馬探每個(gè)人鎖定的嫌犯都不相同，即便如真相也只有一個(gè)！

竹內(nèi)先生因?yàn)檎厥绿右荻粰z察官拘留，可妃英理認(rèn)為竹內(nèi)既然是自首并主動(dòng)承認(rèn)罪行應(yīng)該有被保釋的權(quán)利，之后，柯南和小五郎經(jīng)過(guò)調(diào)查發(fā)現(xiàn)撞人的可能是竹內(nèi)的妻子，于是，妃英理以此為籌碼再次要求放人，可沒(méi)想到的是竹內(nèi)才被保釋出獄，他就在自家陽(yáng)臺(tái)跳樓自殺，而目擊證人正是九條檢察官，為探尋真相，柯南和小五郎重返案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)……