小五郎，蘭，柯南一行人受到虎田直信的委托，負(fù)責(zé)調(diào)查他的兒子義郎離奇死亡的案件，與此同時(shí)，服部在虎田的死對(duì)頭龍尾家調(diào)查他兒子康司的死亡，與義郎相同，康司的尸體旁也擺放了一只死蜈蚣。當(dāng)晚，和葉和小蘭看到了身著鎧甲的戰(zhàn)敗武士的影子，得知此事后，龍尾家的綾華神大驚失色跑了出去，而發(fā)現(xiàn)她的時(shí)候，她已經(jīng)被吊死在一顆樹(shù)上，腳下同樣出現(xiàn)了一只死蜈蚣。

新一、小蘭和阿笠博士依照暗號(hào)的指示一路來(lái)到了米花辦事處，并在樓頂找到了最后一個(gè)暗號(hào)，這個(gè)寫(xiě)有s→w的暗號(hào)到底是何含義？阿笠博士說(shuō)這或許代表方向，而此時(shí)出現(xiàn)在西南方的竟是泛紅的夕陽(yáng)，新一認(rèn)為這都是爸爸想讓自己看到落日才出的暗號(hào)。講完這個(gè)十年前的故事后，柯南突然發(fā)覺(jué)有哪里不對(duì)，便重新將這個(gè)事件重新梳理，驚奇發(fā)現(xiàn)這個(gè)謎題其實(shí)是……

小五郎載柯南和小蘭去泡溫泉的時(shí)候，目暮警官突然打來(lái)電話，說(shuō)他們租來(lái)的這輛車(chē)子上被人安裝的炸彈而且時(shí)速必須保持在20公里以上，否則就會(huì)引起爆炸，面對(duì)這種突發(fā)狀況，小五郎只能繼續(xù)開(kāi)車(chē)等待警察前來(lái)救援，但是即使打破玻璃救走小蘭和柯南，卻依舊無(wú)法保證小五郎的安全，如何讓車(chē)子在保持時(shí)速的情況下停止？犯人到底與小五郎又有何恩怨？

30年前，莊堂胡桃被一位少年從車(chē)禍中救回一命，如今，她想把偶然中得的一億獎(jiǎng)金轉(zhuǎn)送給自己的恩人，線索就是少年身上巨大的疤痕以及夏日海灘的記憶，期間，有兩名男子前來(lái)認(rèn)領(lǐng)，為了辨認(rèn)誰(shuí)才是正牌貨，柯南他們來(lái)到了莊堂家，沒(méi)想到在這里碰到了正在追查快要超過(guò)追訴期的殺人案的目暮警官，因?yàn)槟敲麅词稚砩弦灿幸坏纻邸．?dāng)晚，小五郎泡澡的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)管家保谷泰輔背上有一道傷痕，胡桃回憶中的少年究竟是誰(shuí)呢？

小說(shuō)家萬(wàn)田年久在旅館里趕寫(xiě)小說(shuō)，在編輯島木催稿離開(kāi)房間后，萬(wàn)田化裝成服務(wù)生，帶著貓咪諾貝爾離開(kāi)了旅館。萬(wàn)田路過(guò)柯南等人打簡(jiǎn)易棒球的場(chǎng)地，進(jìn)入了弟子原本高平的家。萬(wàn)田從代理作者原本那里得到原稿后，將其殺害了。而偶然將球打入的柯南一行進(jìn)入房間后發(fā)現(xiàn)了被殺的原本。柯南則發(fā)現(xiàn)了萬(wàn)田的不自然。