為了紀(jì)念戰(zhàn)國武將信長入主岐阜城450周年，偵探少年團(tuán)和阿笠博士來到岐阜市內(nèi)游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當(dāng)?shù)氐挠⑿坌惚硌荨１硌萁Y(jié)束后，光彥因想得到簽名而獨(dú)自返回觀看場所，然而他卻在尋找表演人員的過程中遭到綁架……與此同時(shí)，在博物館展出的信長公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

柯南等人來到方斗寺調(diào)查會(huì)預(yù)知未來的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內(nèi)留宿。正當(dāng)眾人享用晚飯時(shí)，突然從房內(nèi)傳出一聲慘叫，原來是正在房中念經(jīng)的住持被人殺害。毛利小五郎通過柯南在院內(nèi)找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當(dāng)兇手跪地坦白自己的罪行時(shí)，柯南突然發(fā)現(xiàn)案件并沒有結(jié)束……

柯南確信被警察盯上的千野并不是真正的犯人，而尸體的第一發(fā)現(xiàn)者福田先生和催促番藤與天城協(xié)商的江崎小姐都有殺人的機(jī)會(huì)，但在調(diào)查中柯南并沒有得到這方面的線索。案件的條理逐漸明確，犯人殺死天城和番藤的目的是為了陷害千野，想起千野偶爾擔(dān)任推理小說新人獎(jiǎng)的審查后另一條線索出現(xiàn)了。

毛利小五郎撿到一張中了大獎(jiǎng)的賽馬彩票，便帶著柯南和小蘭一起去壽司店慶祝。壽司店內(nèi)新來的廚師很喜歡推理，與毛利小五郎交談甚歡，期間有三名客人陸續(xù)來到壽司店用餐。就在大家酒足飯飽準(zhǔn)備離開時(shí)，突然有一名客人沖進(jìn)店內(nèi)，聲稱店里有人偷了自己的手包。隨后這名客人在壽司店的洗手間內(nèi)找到了遺失的手包，經(jīng)過一番檢查后，她告訴眾人自己丟了一張中獎(jiǎng)的賽馬彩票。

唐三放心不下父親唐昊，知道他是因?yàn)樗寄钏廊サ钠拮尤貌湃杖战杈茲渤睿脐唤杩诨貋砟媚歉槪吞脐灰酪老e，唐昊答應(yīng)以后不再喝酒，對唐三千叮嚀萬囑咐，唐三發(fā)誓要做最厲害的魂師，希望學(xué)成歸來唐昊能把母親的事全部告訴他。村長帶著唐三很快來到諾丁魂師學(xué)苑，自稱大師的玉小剛在門口悠然自得看書，他檢驗(yàn)了唐三的武魂就放行，學(xué)員柳龍卻攔住了唐三，對他冷嘲熱諷一番，逼他拿出推薦信，唐三沒有推薦信，素云濤事先給了他一塊武魂殿的推薦令，讓他直接來學(xué)苑當(dāng)附課生，而且學(xué)費(fèi)和食宿全免，柳龍對唐三出言不遜，要把村長趕走。蕭塵宇及時(shí)趕來為唐三解圍，他是諾丁城城主的兒子，是唐三的同門，熱情歡迎他入學(xué)，還幫他安排好宿舍，村長才放心離開了。蕭塵宇聽說唐三是武魂殿推薦的，斷定他的武魂是很特別的，唐三承認(rèn)是藍(lán)銀草，柳龍對這個(gè)廢武魂嗤之以鼻，唐三自詡天生滿武魂，蕭塵宇和柳龍立刻驚呆了，斗羅大陸上很少有人擁有天生滿武魂。玉小剛立刻追上唐三，根據(jù)他的研究推測唐三應(yīng)該不止一個(gè)武魂，所以他苦苦追問唐三的另一個(gè)武魂，唐三想起父親的囑托，他找各種借口掩飾，玉小剛知道他在說謊，也沒有多問，就帶他去辦入學(xué)禮，還簡單介紹了學(xué)苑的情況，玉小剛讓唐三