就在媒體哄作一團(tuán)采訪及川的時(shí)候，柯南獨(dú)自展開(kāi)了調(diào)查，他從守畫(huà)室的門(mén)衛(wèi)那里得知了及川在案發(fā)前的小動(dòng)作，之后又在屋后發(fā)現(xiàn)了釣魚(yú)線，受到高木警官魔術(shù)的啟示，柯南破解了兇手的作案手法同時(shí)也得知了《青嵐》的所在，他利用老方法將小五郎麻醉并重現(xiàn)案發(fā)時(shí)的場(chǎng)景，最終將犯人繩之以法。案件了結(jié)以后，柯南雖戳破基德的偽裝，但這次他能抓到基德嗎？

柯南、小蘭和園子一起去醫(yī)院看望國(guó)中同學(xué)的時(shí)候，遇到了拿著照片四處詢問(wèn)的本堂英祐，照片上的人正是水無(wú)憐奈，但英祐卻堅(jiān)持認(rèn)為水無(wú)憐奈和姐姐是兩個(gè)人，于是，小蘭打電話給水無(wú)憐奈的超級(jí)粉絲庵野進(jìn)行確認(rèn)，沒(méi)想到對(duì)方竟然說(shuō)她打錯(cuò)了，隨后一行人來(lái)到庵野家，他的母親正準(zhǔn)備出門(mén)取錢(qián)，柯南察覺(jué)到事有蹊蹺，斷定讓她打錢(qián)的那個(gè)人根本就是詐欺犯，在大家的幫助下，詐欺犯被送往了警局，而尋找水無(wú)憐奈也進(jìn)入了正題。

警察在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)筆記本，上面以流動(dòng)日記的形式寫(xiě)著這四名死者害死甲斐先生的秘密，根據(jù)這個(gè)筆記本，大和警官推測(cè)兇手就是因?yàn)閮?nèi)疚而動(dòng)手殺人的繁次。但是還有疑點(diǎn)并未解開(kāi)，于是，柯南和服部?jī)扇嗽俅蝸?lái)到了綾華的死亡現(xiàn)場(chǎng)，并從一名警察那里聽(tīng)到了關(guān)鍵的線索，兇手就是……

根據(jù)紙飛機(jī)上的圖案，柯南和沖矢幾乎在同一時(shí)間明白這是急救用的摩斯密碼，而投紙飛機(jī)的人想傳達(dá)的則是緊急求救的信息，之后，小蘭將其他兩只紙飛機(jī)發(fā)到新一的手機(jī)上，將這三個(gè)帶有暗號(hào)的紙飛機(jī)串聯(lián)在一起，新一推斷出被綁架的人就是電視上成日?qǐng)?bào)道的代田社長(zhǎng)以及他所在的地點(diǎn)，得知這些以后，小蘭不顧自己的安危沖進(jìn)了綁匪的據(jù)點(diǎn)。

沒(méi)過(guò)多久，綁匪就打來(lái)電話威脅柯南他們盡快找到寶藏，不然難?；以麄儼踩?。人命關(guān)天，柯南絞盡腦汁想要破解暗號(hào)，他發(fā)現(xiàn)萩市地圖與貓圖相吻合，而貓眼的地方就是線索的所在，于是，他們來(lái)到了円政寺，并在這里找到了日記中被撕掉的一頁(yè)，柯南將這些零散的圖片拼接成一條路線，大伙兒照此地圖找到了一個(gè)地下山洞，就在寶物將要到手之時(shí)，黑衣人綁匪出現(xiàn)……