京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內(nèi)外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀(jì)曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻(xiàn)書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀(jì)曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點(diǎn)燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨(dú)特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認(rèn)為一切都因紀(jì)曉嵐而起，決定替父報仇，紀(jì)曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

紀(jì)曉嵐見狀于大殿之上說出齊家借職務(wù)之便大肆斂財并佯裝出殯轉(zhuǎn)移錢財?shù)氖聦?shí)。乾隆聞聽此言，意識到紀(jì)曉嵐所指正是自己寵妃的舅舅，于是指責(zé)紀(jì)曉嵐道聽途說。齊蘇圖找到受到乾隆寵幸的銀妃幫忙，銀妃表示會替舅舅擺平此事。齊蘇圖重金賄賂和?|。兩人商議挨家挨戶用散銀換取丟失的庫銀以掩蓋罪證。得知可以用元寶和官府換取兩倍的散銀，百姓皆經(jīng)受不住誘惑。厲春梅的小弟厲小春也撿到了兩枚元寶，但厲家姐弟并沒有以此換取銀兩。紀(jì)曉嵐得知有此等好事，跟小月軟磨硬泡要了一個元寶，也要去以少換多。當(dāng)他滿心歡喜之時，卻被告之只換印有內(nèi)務(wù)府字樣的元寶。紀(jì)曉嵐故意鬧事，被抓進(jìn)牢里。和?|讓牢頭用高價換紀(jì)曉嵐的元寶，好趕快打發(fā)走紀(jì)曉嵐。誰知紀(jì)曉嵐換完散銀后，卻以被捕理由不明為由，拒絕出獄。

紀(jì)曉嵐以虛套實(shí)，誘騙燕城知府交待出他與欽差大臣福康安等共同侵吐賑災(zāi)糧款的罪行，努力搜集各種證據(jù)。隨之而行的小月天真、率真，常常不假思索地流露出實(shí)情。幸虧紀(jì)曉嵐見機(jī)行事，巧妙周旋，才未露破綻。 莫愁陪皇上費(fèi)勁周折終于找到了奶娘的故居，未料其家人俱已亡故。二人剛要離開，遭一群不明身份者追殺。萬分危急之際，被一雍容華貴的老婦人相救。在老婦人家的高欞上，皇上猛然發(fā)現(xiàn)了與那半片金鎖相吻合的圖案。難道自己的身世之謎馬上就可以云消月明、水落石出了嗎？皇上忐忑不安，扼腕嘆息之間，種種顧慮又上心頭。 福康安以護(hù)駕之名，趕至燕城，指證紀(jì)曉嵐假借和之名，二人對質(zhì)，憑著一副所向披靡的鐵齒銅牙，紀(jì)曉嵐變被動為主動，化腐朽為神奇。弄得那些不明真相的燕城官員莫衷一是，氣得福康安七竅生煙。 和派人以所謂的“天地會”之名，假意擁戴十四王爺篡權(quán)奪位，實(shí)則包藏禍心，以嫁禍?zhǔn)耐鯛敹够噬戏艞墝ω澪郯傅年P(guān)注，四姑娘覺察到其中盤根錯節(jié)的險情，將王爺救出。 皇上步入佛堂，手中半片金鎖與桌上的金鎖恰是一對，臉上一片難掩之情，恰在此時，身后射來一簇飛鏢。

書院承諾，只要考上本院便可分文不收，還保證中舉。正在紀(jì)曉嵐驚詫之時，窮書生徐有慶闖進(jìn)考場，痛斥科舉考試的黑暗之處。紀(jì)曉嵐感嘆徐有慶才智兼?zhèn)洹＝?jīng)小月打探，此書院的贊助人為“驢肉先生”。紀(jì)曉嵐堅信其中有蹊蹺，決定追查下去。紀(jì)曉嵐與小月在一驢肉館遇到在此做工的徐有慶，徐有慶表示當(dāng)今科舉考試已成為牟利賺錢的營生，清白的讀書人都以此不齒。紀(jì)曉嵐帶和珅來到坐落于驢肉胡同的和珅故邸，回想舊日辛酸，和珅承認(rèn)自己就是驢肉先生以及自己愛才助才的苦心，并將紀(jì)曉嵐帶至?xí)骸＜o(jì)晚嵐驚訝地發(fā)現(xiàn)徐有慶就在其中，但言語卻猶如陌生人。紀(jì)曉嵐設(shè)局，讓乾隆假扮店小二以聽到和珅興辦書院的目的。和珅坦言，興辦書院只為培養(yǎng)自己勢力，治學(xué)是假，謀私是真。乾隆大怒，罰和珅承擔(dān)此次恩科考生的所有費(fèi)用，并讓紀(jì)曉嵐頂替和珅管理書院。和珅到處去宣揚(yáng)自己傾囊治學(xué)。當(dāng)?shù)弥∮H自命題時，和珅買通乾隆身邊的太監(jiān)王喜偷題。

小芳自首，表示自己殺死了姐姐。紀(jì)曉嵐責(zé)怪小月擅自將海升之事告訴小芳，將事態(tài)嚴(yán)重化。貴寧、賈三光天化日要劫走香兒，香兒在廝打中不慎撞死。當(dāng)聽說逃走的打手是長了四指的任五，紀(jì)曉嵐豁然開朗。得知小芳就是昔日選秀時大鬧順貞門的人，乾隆派紀(jì)曉嵐和綿恩重審小芳。小芳公堂之上自欖罪責(zé)，紀(jì)曉嵐讓海升與其對質(zhì)，海升與小芳爭相認(rèn)罪，紀(jì)曉嵐與和珅陪乾隆去戒臺寺。方丈受紀(jì)曉嵐委托。將李二原本為一村夫野漢，卻因得到官宦輔佐而搖身一變成為活佛的真相告知乾隆。紀(jì)曉嵐發(fā)現(xiàn)任五藏匿在此。在豆腐坊無意中得知黃豆受潮發(fā)芽的力量足以頂動石頭而得出佛像破土而出是因?yàn)橥林新裼悬S豆的結(jié)論后，紀(jì)曉嵐找到綿恩，讓其派兵捉拿李二以及任五。