柯南離開時(shí)雖交代元太他們把追蹤眼鏡交給警方，但想要立功的偵探團(tuán)卻私自行動(dòng)，并利用眼鏡找到柯南的位置，正要打電話報(bào)警的時(shí)候被歹徒發(fā)現(xiàn)。眼看就能將TWO-MIX解救，柯南卻因元太等人的綁架，再度落入敵人手中，他戳穿歹徒想要練習(xí)帶的目的后，歹徒惱羞成怒點(diǎn)燃屋內(nèi)的汽油，柯南等人能否成功逃脫？

柯南小蘭等人在修好高中看棒球賽時(shí)，理事長室的優(yōu)勝錦旗被人割破，就在大家議論誰是犯人時(shí)，棒球隊(duì)主投小偉自首說這件事是自己做的，而他的母親卻說是她做的，柯南認(rèn)為事情不會(huì)那么簡單，便和園子偷偷溜到理事長室，仔細(xì)觀察了錦旗后，他知道了犯人是誰，并利用變聲領(lǐng)結(jié)將大家叫到理事長室揭露了兇手。

就在警察要強(qiáng)行帶走小五郎時(shí)，柯南在機(jī)械室和浜田的尸體上發(fā)現(xiàn)的有力證據(jù)幫他洗清了嫌疑，而目前最有可能殺人的就是上原，當(dāng)大家要暗中逮捕上原時(shí)，木下出面說自己去勸他自首，五分鐘后，屋內(nèi)響起槍聲，上原射傷木下逃跑?？履现匦禄氐礁o神號(hào)調(diào)查并和鈴一起進(jìn)入海軍山洞，卻在這里發(fā)現(xiàn)上原的尸體……

新一遭到某人綁架到白色房間，而且被迫回想起許多過去發(fā)生的案件。新一好像突然想到什麼，對(duì)著小蘭說”這一切都是你做的”。可是就在此時(shí)，兩人突然被玻璃隔開，房間里放出白色的煙霧，不久後兩人都失去了意識(shí)。當(dāng)新一醒來的時(shí)候，已經(jīng)離開白色房間，而且在現(xiàn)場(chǎng)有很多警察。第一個(gè)反應(yīng)就是要找小蘭的他，卻發(fā)現(xiàn)法醫(yī)站在小蘭身邊，而且後來還告訴她小蘭已經(jīng)死掉的消息...

小五郎應(yīng)畫家花岡之邀前來談話，可是等了許久仍沒見到花岡的身影，就在小五郎生氣要離開時(shí)花岡出現(xiàn)，與此同時(shí)，另一位住在對(duì)面的女插畫家蝶野打來電話說要自殺，柯南等人親眼看到蝶野從樓下墜落，趕到現(xiàn)場(chǎng)時(shí)蝶野已死，而這個(gè)看似自殺的案件其實(shí)是他人謀殺，兇手就是花岡，可蝶野從樓上跳下時(shí)，花岡正和大家在一起，他到底是怎么做到的？