就在媒體哄作一團采訪及川的時候，柯南獨自展開了調(diào)查，他從守畫室的門衛(wèi)那里得知了及川在案發(fā)前的小動作，之后又在屋后發(fā)現(xiàn)了釣魚線，受到高木警官魔術(shù)的啟示，柯南破解了兇手的作案手法同時也得知了《青嵐》的所在，他利用老方法將小五郎麻醉并重現(xiàn)案發(fā)時的場景，最終將犯人繩之以法。案件了結(jié)以后，柯南雖戳破基德的偽裝，但這次他能抓到基德嗎？

FBI的所有警員立刻將送至各個病房的炸彈進(jìn)行回收，就在這時，水無憐奈出現(xiàn)在電視上，為一探究竟，所有搜查員都聚集到水無憐奈的病房，卻發(fā)現(xiàn)她好好的躺在那里，而這其實才是黑暗組織的目的，他們在炸彈上還安裝了發(fā)訊器，這樣一來水無憐奈的位置一目了然。既然已經(jīng)暴露，那就只能立刻將她轉(zhuǎn)移，為混淆視聽，F(xiàn)BI派出了三輛車，但即便如此今恩還是做出了判斷。

柯南他們很快就找到了被害者們常去的麻將館，并從老板那里得知，曾有一個叫鬼保獨郎的人與平棟堂次發(fā)生過沖突，抓到嫌疑犯后，高木警官便前去找曾聽到兇手聲音的鍋井永貴做指認(rèn)，沒想剛進(jìn)門就被人打昏。另一邊，柯南因為步美一句玩笑話，突然想通了Z的含義并說兇案早在十五年前就結(jié)束了，此次兇案的發(fā)生不過是模仿犯所為而兇手就在被害者的家屬之中。

放課后，小林老師神神秘秘的讓同學(xué)們都離開教室，待大家午餐完畢返回教室，卻發(fā)現(xiàn)黑板上留有一張“怪人二百面相”的字條，柯南一眼就看穿了這個江戶川亂步迷老師的意圖，之后，同學(xué)們又紛紛從自己的抽屜里找到了數(shù)字和篩子的圖紙，柯南輕松看出暗號的所指，就在他要揭秘時卻被廣播叫走，解謎的重任就交給了1年B班所有同學(xué)，沒有柯南的幫助，他們能否解開暗號找到老師呢？

小說家萬田年久在旅館里趕寫小說，在編輯島木催稿離開房間后，萬田化裝成服務(wù)生，帶著貓咪諾貝爾離開了旅館。萬田路過柯南等人打簡易棒球的場地，進(jìn)入了弟子原本高平的家。萬田從代理作者原本那里得到原稿后，將其殺害了。而偶然將球打入的柯南一行進(jìn)入房間后發(fā)現(xiàn)了被殺的原本。柯南則發(fā)現(xiàn)了萬田的不自然。