藤枝干雄被殺，雖然家中每個(gè)人的反應(yīng)有著微妙的差別，但卻都有不在場(chǎng)證據(jù)。在警方的調(diào)查之后，在妃英理和有希子的推理下判定為內(nèi)部作案。而在有希子詢問了園丁土肥之后眾人又發(fā)現(xiàn)了新的疑點(diǎn)。在父親工藤優(yōu)作的暗示基礎(chǔ)上，柯南了解了兇手作案的手法，而最終有希子在柯南的幫助下揭開了事件的謎底。

高木警官和佐藤警官瞞著警局里的同事們，偷偷在熱帶樂園的水世界見面，為了阻撓他們的約會(huì)，警局的同事們暗中搗鬼，安排柯南，光彥等人出現(xiàn)在他們面前，就在這個(gè)時(shí)候，高木警官原本裝有求婚戒指的包居然出現(xiàn)毒品，之后，他意識(shí)到這一定是在搭乘“海地五萬(wàn)里列車”時(shí)被人調(diào)了包，柯南根據(jù)這個(gè)包包的肩帶判斷出他的主人是個(gè)左撇子，并根據(jù)當(dāng)時(shí)所拍攝的照片和游客所填寫的信息表，將目標(biāo)鎖定在一個(gè)叫高城登的人身上。

因?yàn)榇跬皆谡◤椛涎b了竊聽器，可以聽到他們的一舉一動(dòng)，只要他們一逃走，歹徒就會(huì)馬上引爆炸彈，于是，柯南建議將炸彈拆除，期間，他突然想起了關(guān)于另外一枚炸彈的線索，便和高木警官稍作商量，為正在竊聽他們的歹徒演上一出戲，眼看炸彈上的時(shí)間一點(diǎn)點(diǎn)流逝，柯南和高木警官能否瞞過(guò)歹徒安全逃脫？而另一邊，目暮警官在天橋上將爆炸狂逮捕，他是如何得知歹徒的位置，又是根據(jù)什么推斷出另外一枚炸彈的位置呢？

柯南和阿笠博士帶著發(fā)著高燒的哀去了在東都百貨里的醫(yī)療室。在那里的地下停車場(chǎng)里柯南認(rèn)識(shí)了四輛保時(shí)捷的主人們。四人同乘了一輛車來(lái)打高爾夫球，但是其中一個(gè)人喝得爛醉，于是其余的人就把他留下去了進(jìn)了百貨商店。不久卻發(fā)現(xiàn)了醉酒男人被勒死的尸體。而柯南也因?yàn)榕加鲭娨暡稍L而陷入暴露身份的危機(jī)之中。

懷疑小蘭的高中英語(yǔ)教師朱蒂是黑衣組織的成員而拜訪公寓的服部平次與柯南，遇上朱蒂隔壁房間的主人高井墜樓摔死的案件。確信密室狀態(tài)的臥室從窗戶墜落的高井不是自殺而是他殺的兩人，在臥室調(diào)查中的平次接到和葉從大版打來(lái)的電話而明白犯罪手段的平次加上高井留下的證據(jù)。兩人向目暮警官建議在臥室重現(xiàn)案發(fā)。