柯南用收據(jù)做出的特殊暗號被貓咪帶去保羅咖啡廳的時(shí)候被風(fēng)吹走了，在冷柜的他們情況很不樂觀，不能坐以待斃的他們又更改了送往阿笠博士家蛋糕的收獲地址，察覺到異樣的昴先生郵寄手機(jī)給貨柜里的柯南，但這一手法卻被犯人發(fā)現(xiàn)了。讓柯南沒有想到的是，前來解救他們的竟然是看到特殊暗號收據(jù)的波本。

接受汀小姐的邀請小五郎一行人來到了大濱海岸，在汀小姐的家里小五郎等人遇到了她的丈夫海四郎，兩人因?yàn)闆_浪的事情起了爭執(zhí)。傍晚海四郎找到小五郎等人表示汀小姐不見了，看到汀小姐發(fā)來的短訊后海四郎先行回到家中，而第二天早上小五郎等人卻在海灘上發(fā)現(xiàn)了汀小姐的尸體，而她的尸體旁邊卻沒有留下任何足跡。

為了補(bǔ)償先前被卷入鈴木號特快車內(nèi)發(fā)生的恐怖事件，園子邀請毛利一家和柯南前往度假，而暴露身份的波本竟然以網(wǎng)球特別教練的身份也出現(xiàn)在那里，被球拍砸到的柯南不幸受傷，簡單的治療之后他被帶到附近網(wǎng)球社成員的別墅休息，當(dāng)他醒來時(shí)卻發(fā)現(xiàn)房間里有一具不自然的尸體。

結(jié)束大致的案件詢問之后柯南一行人決定開車送圭小姐回家，卻發(fā)現(xiàn)圭小姐家中被安裝大量的竊聽器，在尋找竊聽器的安裝地點(diǎn)時(shí)竟然找到了一具男尸。另一方面跟著打算買東西的圭小姐而離開公寓的柯南被綁架，接到小蘭的電話后阿笠博士立即和灰原在昴先生的陪同下開始追蹤，而了解了事情始末的世良也前去和小蘭會面。

以幕末的長崎為舞臺，有坂本龍馬擔(dān)任的偵探而活躍的推理劇，正在負(fù)責(zé)寫腳本的編劇家耕作先生突然消失蹤影，只寫了一半的劇本則委托小五郎先生幫忙推理出劇中的真正犯人，調(diào)查了耕作房間的柯南等人發(fā)現(xiàn)了許多古董美術(shù)品竊盜團(tuán)的簡報(bào)，這一切似乎都有著隱情。失蹤中的耕作先生利用郵件將后續(xù)的劇本傳送過來，在劇本中出現(xiàn)了奇怪的臺詞。