為了紀(jì)念戰(zhàn)國(guó)武將信長(zhǎng)入主岐阜城450周年，偵探少年團(tuán)和阿笠博士來(lái)到岐阜市內(nèi)游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當(dāng)?shù)氐挠⑿坌惚硌荨１硌萁Y(jié)束后，光彥因想得到簽名而獨(dú)自返回觀看場(chǎng)所，然而他卻在尋找表演人員的過(guò)程中遭到綁架……與此同時(shí)，在博物館展出的信長(zhǎng)公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

鷹取嚴(yán)男在取回寶石后將柯南扔在了馬路中間的綠化帶中，柯南受不住沖擊昏了過(guò)去，當(dāng)他醒來(lái)時(shí)鷹取早已不見(jiàn)蹤影。柯南隨后被送到醫(yī)院檢查，所幸身體沒(méi)有受傷。柯南想弄清案件的真相，趁病房沒(méi)人偷溜出去尋找線索。他先去尋找之前在鷹取身上發(fā)現(xiàn)的酒吧地址，在酒吧隔壁的房間里竟然發(fā)現(xiàn)了被盜珠寶店的采購(gòu)員的尸體。

死者被殺時(shí)手里握著剪刀，尸體的傷口處還粘滿了蜂蜜，不僅如此，案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的水龍頭還一直開(kāi)著，柯南和昴確定兇手就是零食店的仙波先生，但他們還一時(shí)半會(huì)兒找不到兇器。在詢問(wèn)了保鏢后柯南有了一些線索，阿笠博士在院子里看到的成群螞蟻也為他們提供了幫助，兇手到底是運(yùn)用了什么手法來(lái)作案的呢？

唐三放心不下父親唐昊，知道他是因?yàn)樗寄钏廊サ钠拮尤貌湃杖战杈茲渤睿脐唤杩诨貋?lái)拿那根針，和唐昊依依惜別，唐昊答應(yīng)以后不再喝酒，對(duì)唐三千叮嚀萬(wàn)囑咐，唐三發(fā)誓要做最厲害的魂師，希望學(xué)成歸來(lái)唐昊能把母親的事全部告訴他。村長(zhǎng)帶著唐三很快來(lái)到諾丁魂師學(xué)苑，自稱(chēng)大師的玉小剛在門(mén)口悠然自得看書(shū)，他檢驗(yàn)了唐三的武魂就放行，學(xué)員柳龍卻攔住了唐三，對(duì)他冷嘲熱諷一番，逼他拿出推薦信，唐三沒(méi)有推薦信，素云濤事先給了他一塊武魂殿的推薦令，讓他直接來(lái)學(xué)苑當(dāng)附課生，而且學(xué)費(fèi)和食宿全免，柳龍對(duì)唐三出言不遜，要把村長(zhǎng)趕走。蕭塵宇及時(shí)趕來(lái)為唐三解圍，他是諾丁城城主的兒子，是唐三的同門(mén)，熱情歡迎他入學(xué)，還幫他安排好宿舍，村長(zhǎng)才放心離開(kāi)了。蕭塵宇聽(tīng)說(shuō)唐三是武魂殿推薦的，斷定他的武魂是很特別的，唐三承認(rèn)是藍(lán)銀草，柳龍對(duì)這個(gè)廢武魂嗤之以鼻，唐三自詡天生滿武魂，蕭塵宇和柳龍立刻驚呆了，斗羅大陸上很少有人擁有天生滿武魂。玉小剛立刻追上唐三，根據(jù)他的研究推測(cè)唐三應(yīng)該不止一個(gè)武魂，所以他苦苦追問(wèn)唐三的另一個(gè)武魂，唐三想起父親的囑托，他找各種借口掩飾，玉小剛知道他在說(shuō)謊，也沒(méi)有多問(wèn)，就帶他去辦入學(xué)禮，還簡(jiǎn)單介紹了學(xué)苑的情況，玉小剛讓唐三

毛利小五郎帶柯南和小蘭來(lái)高級(jí)餐廳用餐，進(jìn)門(mén)后三人發(fā)現(xiàn)桌上擺滿了食物卻沒(méi)有客人，并在廚房發(fā)現(xiàn)了倒在地上的廚師口石先生。清醒后的口石先生告訴三人，原本有五名客人在餐廳里用餐，不料自己在做飯時(shí)遭到了歹徒的襲擊，客人們也不知去向。毛利小五郎馬上通知了目暮警官，并查清了每個(gè)客人的身份，然而卻難以判斷消失的客人們?nèi)チ撕翁帯Ｕ谶@時(shí)，擺放在餐桌上的甜點(diǎn)和雜物引起了柯南的注意。