解決了暗號(hào)事件回到日本的柯南終于恢復(fù)了正常的生活，在放學(xué)回家的路上元太提議大家進(jìn)入即將拆遷的大樓內(nèi)來玩捉迷藏。就在這時(shí)元太發(fā)現(xiàn)有奇怪的敲打墻壁的聲音，柯南發(fā)現(xiàn)這是有人發(fā)出的求救聲音，就在他們?cè)谒褜さ倪^程中發(fā)現(xiàn)了在檢查大樓的兩個(gè)工人。兩人告訴柯南他們那是他們發(fā)出的響聲不用在意但在柯南的推理下少年偵探團(tuán)們開始尋找被困的人，就在這時(shí)之前的檢查工人卻抓住了小哀，究竟應(yīng)該這應(yīng)該辦！

小五郎受到一個(gè)名叫立李三可的委托，帶著柯南和小蘭一起來到群馬縣調(diào)查真相，途中他們遇見了德備六朗和荒巖，并從他們口中得知了11年前有一個(gè)名叫辰彥的孩子在旅館附近的河中溺斃而亡的事件，這與信中所提及的殺人案有何聯(lián)系？辰彥父親同時(shí)也是約見地點(diǎn)光羅旅館的老板沼山伴藏也讓人覺得很怪異，次日清晨，滿身都是刺鼻氣味液體的伴藏死在了旅館的頂樓房間，難道是小蘭昨晚在河邊看到的河童下的毒手嗎？

柯南、小蘭和小五郎在百貨公司吃飯的時(shí)候，結(jié)識(shí)了樂隊(duì)吉他手中村悠介，之后，小蘭和他一起去地下室拿取CD，沒想到竟然在休息室看到了主唱渡邊友紀(jì)子的尸體，警方立刻展開調(diào)查并且對(duì)樂隊(duì)其他人進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都有殺人的動(dòng)機(jī)和嫌疑，就在他們互相指責(zé)懷疑之時(shí)，柯南在八樓發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵性的線索，兇手果然就是那個(gè)人！

小五郎受邀參加浦井食品創(chuàng)立八周年的紀(jì)念宴會(huì)，浦井社長在每年的宴會(huì)上都會(huì)進(jìn)行魔術(shù)或短劇之類的表演，所以賓客們也都非常期待他今年的表演，然而，宴會(huì)期間浦井社長卻大叫一聲倒了下來，就在大家都以為他今年表演是懸疑推理短劇時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)浦井社長真的停止了呼吸，警方查出他是中毒而死，當(dāng)時(shí)離死者最近的人就是他的夫人浦井星江。

這三輛白色FD的后備箱中分別放置了釣魚桿、高爾夫球袋和橡皮艇，就在警方準(zhǔn)備進(jìn)一步調(diào)查時(shí)，曾經(jīng)與銀白魔女有過一面之緣的山村警官的奶奶否認(rèn)了銀白魔女就在他們其中，雖然沒能找到魔女，但柯南卻注意到有一組車手的供詞中有疑點(diǎn)，于是，他和小五郎再次駛向霧蒙蒙的冬名山，而魔女的白色FD也再次出現(xiàn)，這一次他們能成功狩獵魔女嗎？