小蘭、園子和柯南三人滑雪時(shí)，意外的碰到小蘭的小學(xué)老師米原等人，并在他們的邀請(qǐng)下住進(jìn)了滑雪別墅里，當(dāng)晚，園子和米原被人襲擊，之后還發(fā)現(xiàn)了遲到的杉山被人勒死的尸體，他們?nèi)齻€(gè)人手上分別寫(xiě)著「美」「奈」「子」三個(gè)字，看到這些字下田回到自己房間躲起來(lái)，柯南和阿笠博士聯(lián)系后得知三年前杯戶小學(xué)發(fā)生過(guò)自殺案件，當(dāng)時(shí)自殺的學(xué)生就叫望月美奈子。

城中美術(shù)館冒出中世紀(jì)盔甲會(huì)自己走路的傳聞，引起了小蘭濃厚的興趣打算一探究竟，沒(méi)想到卻意外地發(fā)現(xiàn)美術(shù)館在一周后即將關(guān)閉。而購(gòu)買(mǎi)美術(shù)館的購(gòu)買(mǎi)者真中計(jì)劃將這里改造成酒店。小蘭一行在參觀地獄館的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)真中被釘在墻上，而在回放錄像的時(shí)候發(fā)現(xiàn)竟然是展覽的盔甲將真中殺害！但在回放了錄影帶和勘察現(xiàn)場(chǎng)之后柯南發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法并找出了真兇。

小五郎帶著小蘭等人去京都參朋友的婚禮，在新干線上柯南看見(jiàn)了兩名可疑黑衣男子，他利用阿笠博士送他的眼鏡竊聽(tīng)到了不得了的事情——這輛新干線上有炸彈并且即將爆炸，眼看黑衣人離開(kāi)新干線，柯南只能憑自己找到那只裝有炸彈的黑皮箱，鎖定了炸彈所在的車(chē)廂后，柯南對(duì)車(chē)廂里的四人進(jìn)行試探，卻毫無(wú)頭緒，關(guān)鍵時(shí)刻元太的一句話提醒了他。

關(guān)西的名高中生偵探服部平次，為了合氣道比賽而來(lái)到帝丹高中。工藤新一與平次雖然沒(méi)見(jiàn)過(guò)彼此，在心里卻把對(duì)方當(dāng)成對(duì)手，可是表面上又裝出完全不在乎對(duì)方的樣子。後來(lái)平次在去帝丹高中的路上碰到搶匪，與毛利蘭一起在回家途中的新一，也一起幫忙追搶匪。後來(lái)是靠新一踢足球擊中搶匪，不過(guò)也同時(shí)打破一間民宅的玻璃，而里面還傳出女人的凄厲尖叫聲...

小五郎等人代替感冒的阿笠博士到伊豆參加推理之旅。活動(dòng)規(guī)定，如果能夠找出推理之旅的主辦人就可以免費(fèi)住宿并可獲得一個(gè)包含某種病毒程序的磁盤(pán)。但是在旅途中不知什么人扮成暗夜公爵把柯南從欄桿上推了下去！之后柯南打電話詢問(wèn)阿笠博士關(guān)于程序的事情得知了病毒的事情。晚餐后回房間時(shí)柯南和小蘭偶遇和明子發(fā)生口角的前田并被前田邀請(qǐng)卻觀看夜景。就在這時(shí)暗夜公爵卻墜樓生亡！