警察局的小五郎案件調(diào)查被盜。迷般的黑色神秘組織也許就在附近。柯南懷疑杯戶市酒店也許還有皮斯克的同伴，收集情報(bào)的美國(guó)女演員克麗絲。同時(shí)柯南與平次為刺探可疑的外國(guó)女性、英語(yǔ)教師朱蒂的情報(bào)，一起去朱蒂的家里。就在這時(shí)從公寓上有名男性墜樓。就在暮目警官準(zhǔn)備以自殺事件結(jié)案的時(shí)候平次指出了他殺的證據(jù)。

園子的大伯次郎吉因?yàn)楣直I基德曾經(jīng)搶了他大出風(fēng)頭的機(jī)會(huì)，而一直耿耿于懷，便不惜人力物力發(fā)誓抓住基德，他以“藍(lán)色奇跡”為誘餌高調(diào)的在報(bào)紙上向基德下戰(zhàn)書(shū)，不想基德居然回應(yīng)了他的挑戰(zhàn)，并說(shuō)自己會(huì)走著去盜取“藍(lán)色奇跡”，在正式盜取之前，基德先前往博物館查看地形，面對(duì)層層包圍的警察和直升機(jī)，他就這樣突然懸浮在空中出現(xiàn)在眾人面前，不但如此，他還在沒(méi)有任何設(shè)備的狀況下，泰然自若的在空中漫步。

柯南去看望同學(xué)片岡純，結(jié)果被人誤認(rèn)為是純而遭到綁架。很快，綁架犯吉澤正向純的父親片岡茂電話要求贖金3千萬(wàn)圓。并且指名交付贖金的必須是片岡的再婚的對(duì)方江崎幸子。吉澤在公園得到放有幸子送去的贖金的蜂蜜便當(dāng)，乘輕四輪車(chē)逃走。但是，在警察的追蹤中，車(chē)子突然消失在隧道里！

因?yàn)榇跬皆谡◤椛涎b了竊聽(tīng)器，可以聽(tīng)到他們的一舉一動(dòng)，只要他們一逃走，歹徒就會(huì)馬上引爆炸彈，于是，柯南建議將炸彈拆除，期間，他突然想起了關(guān)于另外一枚炸彈的線索，便和高木警官稍作商量，為正在竊聽(tīng)他們的歹徒演上一出戲，眼看炸彈上的時(shí)間一點(diǎn)點(diǎn)流逝，柯南和高木警官能否瞞過(guò)歹徒安全逃脫？而另一邊，目暮警官在天橋上將爆炸狂逮捕，他是如何得知歹徒的位置，又是根據(jù)什么推斷出另外一枚炸彈的位置呢？

在聽(tīng)取了觀野家主婦節(jié)子與她的婆婆彌生、以及事件前剛剛到訪的津曲水貴和三重仿春4人的供詞之后。柯南從女兒節(jié)人偶的排列方式上發(fā)現(xiàn)了事件的真相。在柯南的解說(shuō)之下大家終于找到消失掉的卷軸。而藏起這個(gè)卷軸的正是老婆婆。她告訴眾人這幅卷軸的由來(lái)以及自己為了孩子賣(mài)掉卷軸的事情。而詛咒的卷軸的謠言也最終不攻自破了。