小五郎的事務(wù)所里來了一個(gè)叫春菜的大學(xué)生，委托小五郎找他的尋呼機(jī)朋友。春菜保存了秋悟先生的尋呼機(jī)和音樂盒，那以后，春菜的尋呼機(jī)上出現(xiàn)了奇怪的留言。小五郎一行找到秋悟的家人，卻發(fā)現(xiàn)秋悟在給春菜送出尋呼機(jī)之前就已經(jīng)死了，而走廊上還出現(xiàn)了奇怪的人影。接著眾人就發(fā)現(xiàn)已經(jīng)被擊暈的阿稔。

柯南一開始就知道兇手是誰，但他卻苦于找不到證據(jù)，然而當(dāng)他無意間看到勒在素夫脖子上的領(lǐng)帶，沒錯(cuò)，證據(jù)就是這個(gè)！另一邊，目暮警官發(fā)現(xiàn)素夫死前所買保險(xiǎn)的受益人是菊代，而且在素夫消失的這段時(shí)間她也曾來過倉庫以及根據(jù)美濃所提供的證詞，這一切線索不得不讓警方懷疑殺死素夫的兇手就是菊代，而菊代也是百口莫辯。這時(shí)，柯南將園子麻醉，借助變聲器將事情的真相一一道出！

為了救被綁架的詹姆斯，少年偵探團(tuán)努力推理他留下的“P&A”的意思。步美把自己的偵探徽章留在了詹姆斯那里使眾人得到了詹姆斯的鎖在位置。他們還得到了佐藤警官等的幫助，向犯人發(fā)起追擊。而經(jīng)過推理，柯南領(lǐng)會(huì)到詹姆斯信息原來指的是自己被綁架到假冒的警車之中。而為了確保詹姆斯的安全，柯南眾人采取了非常的營救手段。

高木剛說完十八年的搶匪就在佐藤正義警官的四位老友之中后，便突然失去了音訊，按照柯南的建議，佐藤警官急忙趕到他們四人所去的酒屋，卻發(fā)現(xiàn)他們?cè)缫央x開，根據(jù)老板的供詞柯南推理出了誰是當(dāng)年的歹徒，他告訴佐藤后，讓她自己去了結(jié)這宗案件。另一邊，步美等人私自跟蹤縱火犯遇到危險(xiǎn)，幸虧柯南及時(shí)趕到才得以獲救，而這名縱火犯也被警方逮捕。

小蘭發(fā)現(xiàn)“影秋村”的村長船木也被殺害。柯南發(fā)現(xiàn)矢部賬戶每月固定打入的匯款，在詢問了駒井關(guān)于7年的事故之后確定了這次的殺人事件與七年前BONNET公交車發(fā)生的事故有關(guān)。在拜托教授調(diào)查了事故之后柯南發(fā)現(xiàn)兇手的身份并發(fā)現(xiàn)兇手欲重演悲劇，他獨(dú)自登上觀光車與犯人對(duì)峙阻止了悲劇的發(fā)生。