與黑色組織面對(duì)面 滿(mǎn)月之夜的兩起神秘事件(之五)柯南昏倒，茱蒂受傷，蓓摩特的槍口指向灰原，千鈞一發(fā)之刻，一直躲在后車(chē)廂的小蘭突然沖出來(lái)，緊緊抱著灰原，面對(duì)這種意想之外的狀況，蓓摩特想起了往事而不忍下手，趁她分神的時(shí)候，與茱蒂同屬FBI的赤井秀一出現(xiàn)，雖然保護(hù)了無(wú)辜的人，但蓓摩特卻以柯南為人質(zhì)成功逃脫。途中柯南從昏睡中蘇醒，接下來(lái)就是柯南與蓓摩特的單獨(dú)對(duì)峙，他能否根據(jù)蓓摩特的電話(huà)找出黑暗組織的boss？

柯南在新出醫(yī)院遇到的老先生說(shuō)了一段讓人匪夷所思的鬼怪理論，為了探求真相，柯南等人來(lái)到了這棟有鬼出沒(méi)的公寓，在其旁邊還有一棟因人自殺而停工的公寓，正前方的公園也曾現(xiàn)過(guò)一具女性的焦尸，這些傳聞聽(tīng)著就叫人毛骨悚然。當(dāng)晚，大家在老先生的房中等鬼出現(xiàn)時(shí)，卻不知不覺(jué)都睡著了，恍惚中，電視自己打開(kāi)并出現(xiàn)了恐怖畫(huà)面，而馬桶的水也突然變成紅色，窗外還出現(xiàn)了鬼影，難道這棟公寓真的有鬼？如果這一切都是人為，那么他又有什么目的呢？？

元太帶朋友們來(lái)到一家寵物店，沒(méi)想到居然發(fā)現(xiàn)了老板白井的尸體，奇怪的是在他的店里居然出現(xiàn)了本不該在這個(gè)季節(jié)出現(xiàn)的甲蟲(chóng)，為了進(jìn)一步進(jìn)行調(diào)查，他們從寵物店里拿了一張群馬縣甲蟲(chóng)博物館的宣傳單，與偶遇的高木一起驅(qū)車(chē)趕往群馬，在這里他們認(rèn)識(shí)了博物館職員荒木、甲蟲(chóng)研究家榛名和雜志社編輯石田，當(dāng)?shù)弥拙粴⒌南⒑螅總€(gè)人都連忙推卸，但根據(jù)目前掌握的線(xiàn)索，兇手一定就在他們?nèi)酥小?/p>

柯南他們與正在公園找尋東西的高木刑事相遇。原來(lái)他在這里調(diào)解吵架后，不小心把遺失了警察手冊(cè)。高木刑事調(diào)解的當(dāng)事人之一是無(wú)名的歌手半崎，好象就住在公園附近。柯南他們分頭找尋半崎，卻不見(jiàn)他人影。正要放棄時(shí)半崎在公園里出現(xiàn)。柯南眾人發(fā)現(xiàn)半崎的疑點(diǎn)，在偵查推理之后眾人救下了顯遭殺害的杉山。高木也找回了自己的警察手冊(cè)。

柯南、小蘭、小五郎等到小天狗山遠(yuǎn)足，目擊了在山頂管理事務(wù)所工作的平井高也從山崖上掉下來(lái)。他們急忙到崖下去看時(shí)，平井已經(jīng)死亡。同事務(wù)所工作的近藤英一郎說(shuō)本來(lái)應(yīng)該是自己去的，為此泣不成聲，警方打算按照事故處理，柯南卻發(fā)現(xiàn)這不是突發(fā)事故而是一起殺人事件！而在調(diào)查之后柯南也發(fā)現(xiàn)了兇手的真實(shí)面目以及犯罪手法！