小五郎等人代替感冒的阿笠博士到伊豆參加推理之旅。活動(dòng)規(guī)定，如果能夠找出推理之旅的主辦人就可以免費(fèi)住宿并可獲得一個(gè)包含某種病毒程序的磁盤。但是在旅途中不知什么人扮成暗夜公爵把柯南從欄桿上推了下去！之后柯南打電話詢問阿笠博士關(guān)于程序的事情得知了病毒的事情。晚餐后回房間時(shí)柯南和小蘭偶遇和明子發(fā)生口角的前田并被前田邀請(qǐng)卻觀看夜景。就在這時(shí)暗夜公爵卻墜樓生亡！

放學(xué)后，光彥一伙兒聚在一起研究寬波段接受器時(shí)，無(wú)意中接聽到了一個(gè)綁架恐嚇電話，大家都很擔(dān)心這個(gè)被綁架的女孩性命，便決定根據(jù)這通電話找到女孩，柯南根據(jù)歹徒陸續(xù)打給女孩爸爸的電話，和伙伴們一步步找到了被害人和歹徒的位置，成功解救人質(zhì)。

得知小蘭要去約會(huì)，柯南死纏爛打的跟著一起去了咖啡店，為哄柯南回家，小蘭外出給他買蛋糕。小蘭離開后，咖啡店里依次來(lái)了幾位客人，有兇巴巴的女人、花花公子、美女律師、大學(xué)生和大塊頭男士，正在柯南猜測(cè)哪位是小蘭的約會(huì)對(duì)象時(shí)，廁所傳來(lái)慘叫，原來(lái)是兇巴巴的女人在廁所被人殺掉，但在柯南和美女律師的推斷下，兇手浮出水面，之后柯南才知道小蘭的約會(huì)對(duì)象居然是……

因洋子推薦慈善高爾夫大會(huì)，小五郎抓緊練習(xí)，而在高爾夫球場(chǎng)還有其他一行人打球，分別是某開發(fā)部的經(jīng)理橘、課長(zhǎng)安井、主任大久保和社員南，橘和安井的技術(shù)非常好，安井將球打完后，休息了一會(huì)兒便離開了，這時(shí)，球場(chǎng)突然發(fā)生爆炸，橘死亡，除離開的安井外，其他兩人均受傷，小五郎順利的推理出兇手就是安井，但柯南確認(rèn)為真兇另有其人……

來(lái)到第4個(gè)房間，日期顯示的是小五郎策劃的一次婚禮的時(shí)間。這天，小五郎的朋友本木結(jié)婚，由小五郎策劃婚禮。新一被小五郎“聘用”為助理。新一在“工作”中發(fā)現(xiàn)本木與一個(gè)叫做娜娜的女生有外遇。在婚禮現(xiàn)場(chǎng)，新人收到了一個(gè)名為“偷吃我就殺了你”的祝福郵件，新一能保護(hù)好大家嗎？