這天小五郎和柯南看到警車駛過，便和目暮警官一同趕往殺人現場。原來是公寓的某屋內發(fā)現了小說家齊川村子的尸體。死因是頭部被物品打擊致死。發(fā)現尸體的是迷宮出版社的編輯遠野舜一和公寓管理員村田啟三。遠野說齊川之前收到了恐嚇的明信片。而在警方的調查下柯南最終發(fā)現了犯人的真面目。

康司、義郎以及綾華這三位死者有一個共同點，那就是他們曾與阿景和繁次一起挖過武田信玄的秘密金山。之后，柯南和服部去龍尾家查看武田信玄的盔甲時碰巧看到了他常用的軍事戰(zhàn)略“風林火山”而這正好與康司、義郎和綾華的死亡狀況相符合，那么，由此可以推斷兇手出接下來可能要施以目標以火刑，就在這時，和葉打來電話說有人倒大火之中，而這個人就是繁次。

小五郎的朋友向日葵酒吧的老板井上弘子意外被人殺害，當他和柯南趕到案發(fā)現場時，弘子的男朋友高岡明已守在尸體旁邊，目暮警官等也展開了調查，據周圍人所說，在案發(fā)期間并沒有人出入死者所在的公寓，并且嫌疑人高岡明當時也有充分的不在場證明，就在警方斷定這是起入室搶劫殺人事件時，柯南發(fā)現了關鍵線索，他重新推斷死亡時間，并斷言這里并非案發(fā)的第一現場。

最有可能犯案的就是第一個沖進房間的染井社長，于是，高木打電話給公司，其中有同事表示曾在案發(fā)時間見過染井出入藥店，而這件事也從藥店員工那里得到了證實，這無疑是染井擺脫嫌疑的最好證明，可他為何只字不提？之后，柯南又注意到了桌子上的蛋糕，在他的提醒下，高木還原了被偽裝的案發(fā)現場，事已至此，染井主動承認自己的罪行，但柯南卻指出兇手另有其人。

在找到的眾多刀具中，并沒有發(fā)現婆婆半夜所打磨的刀，并且阿笠博士發(fā)現自己帶來露營用的錘子也不見了蹤跡，就在柯南思考兇手為何拿走錘子時，步美正準備向魚缸里倒水，他也由此而注意到了水位的下降，斷定兇器就在魚缸中，那么兇手就一定是他！期間，柯南還發(fā)現了婆婆幾十年前就離家的孫子翔太，許久未見，孫子又會以什么樣的表情面對婆婆呢？