阿笠博士帶著少年偵探團(tuán)去朋友家的別墅玩，眾人卻在別墅的院子里發(fā)現(xiàn)一名倒在血泊中的男子，經(jīng)證實(shí)此人正是俗稱“佐羅”的連環(huán)搶劫縱火犯的同黨伊勢原祐二。為了解開謎團(tuán)，柯南只身一人前往深山，目睹了佐羅意圖殺害伊勢的場面。想要解圍的柯南在和伊勢一起逃亡的過程中被逼上了臨海的懸崖，在佐羅的追殺中不慎墜落懸崖的二人命運(yùn)將會(huì)如何？

日賣體育記者加賀爪弘和橋爪明曾在一年前報(bào)道過一篇關(guān)于大企業(yè)老板角山制作所的山角雄三社長去世引發(fā)的遺囑失蹤事件，這兩位記者當(dāng)時(shí)不斷煽風(fēng)點(diǎn)火，將自己挖到的爭奪遺產(chǎn)的丑聞都刊登在雜志上害的親屬爭執(zhí)不斷最后甚至引發(fā)了殺人未遂案。柯南白天在餐館遇到了這兩名關(guān)系很差的記者，沒想到就在當(dāng)晚，加賀爪弘竟然被發(fā)現(xiàn)在河邊遇害。

練習(xí)空手道的京極曾在幼時(shí)受到高見達(dá)人的指點(diǎn)，高見老師的教誨才成就了如今的京極，京極拜訪老師道館的時(shí)候園子拖著柯南也來參觀。高利貸催款的人來到了道場，得知老師要賣掉道場引退后京極非常反對(duì)，京極出去沒多久就聽到了玻璃破碎的聲音，一行人沖出去后發(fā)現(xiàn)道館內(nèi)寶貴的黑帶不見了。

平次與和葉邀請(qǐng)小蘭和柯南一起去看彩燈，在等小蘭與和葉準(zhǔn)備晚飯的期間，平次和柯南去樓下的白羅咖啡館打發(fā)時(shí)間，不料卻恰好遇到了一起殺人未遂的案件。受害者雖沒有生命危險(xiǎn)，但血跡卻濺到了柯南和平次的臉上，二人本以為可以通過血跡找到真兇，萬萬沒想到店內(nèi)的幾個(gè)客人身上均未發(fā)現(xiàn)血跡。正當(dāng)案件調(diào)查一籌莫展時(shí)，店內(nèi)一名自稱和田進(jìn)一的男子突然念起一首和歌，平次和柯南馬上明白了此人的用意，并合力找出了真兇。

柯南和平次傳來歷史學(xué)家的死訊，眾人陷入恐慌，并認(rèn)為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學(xué)家主動(dòng)要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細(xì)節(jié)，院子卻突然再次著火，與此同時(shí)樓上的考古學(xué)家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內(nèi)，待柯南等人趕到時(shí)已經(jīng)喪命。經(jīng)過一番調(diào)查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。