光彥建議讓亞瑟聞道爾的味道幫忙找道爾，可亞瑟卻從和式里叼出一個(gè)坐墊，柯南發(fā)現(xiàn)和式里的坐墊比之前多了一個(gè)，他又將道爾聽(tīng)到時(shí)鐘之后發(fā)生的事情全部梳理了一遍，并且還在客廳的走廊上找到了曾經(jīng)出現(xiàn)在焚化爐里的玻璃棉，有了這些線索一切謎題迎刃而解，找到道爾之后，少年偵探分工合作，將它失蹤時(shí)的場(chǎng)景重演一遍，揪出了藏匿道爾的歹徒。

阿笠博士的朋友加納照也由于近日就要搬家的緣故，所以計(jì)劃將用不到的東西送給朋友，柯南等人在這里遇到了加納在愛(ài)犬協(xié)會(huì)的朋友綱島吉雄、土佐林和蓮木志乃，就在大家思考要帶什么東西回家作紀(jì)念的時(shí)候，加納家飼養(yǎng)的一只小狗道爾不見(jiàn)了，后來(lái)大家在焚化爐里找到道爾脖子上的項(xiàng)圈，但幸運(yùn)的是焚化爐里并未發(fā)現(xiàn)狗的骨骸，那么，道爾到底被歹徒藏在哪里了？他又打算怎么帶走道爾呢？

茂木認(rèn)為小五郎是兇手而開(kāi)槍將他射傷，當(dāng)前來(lái)“黃昏別館”的所有名偵探都命喪黃泉時(shí)，電腦上居然出現(xiàn)了一行關(guān)于寶藏的信息，一直躲在監(jiān)視器操控室的神秘幕后黑手終于按捺不住露出了真面目，沒(méi)想到這個(gè)人居然是……柯南引導(dǎo)她說(shuō)出了整件事的真相，而這時(shí)，本應(yīng)死去的偵探們居然都出現(xiàn)在門(mén)口，可到底是怎么回事？這棟別墅的寶藏又是什么？

柯南，小蘭與小五郎向著溫泉的途中，在遭苛政君主殺害的戰(zhàn)國(guó)武將沖滑秀友的墓前祭祀時(shí)。正巧結(jié)識(shí)了住在這里的一戶人家。還聽(tīng)說(shuō)了關(guān)于秀友鎧甲的詛咒的傳聞。接著那天夜里。也正是秀友500年祭日的那晚，還知道了當(dāng)天也是這家人家中的父親因工廠倒閉即而自殺，即這個(gè)鎧甲原來(lái)的主人的祭日。

灰原這么做的目的是要叮嚀柯南坦白有風(fēng)險(xiǎn)，讓他謹(jǐn)慎考慮，并在他面前擺出三個(gè)選擇，柯南會(huì)如何抉擇？另一邊，帝丹高中園游會(huì)的當(dāng)天，話劇在體育場(chǎng)上演的時(shí)候，觀眾席竟然出現(xiàn)了謀殺案件，這時(shí)，突然出現(xiàn)了一位迷之少年，當(dāng)他摘掉隱藏身份的帽子時(shí)，在場(chǎng)的所有人都驚呆了，許久未露面的工藤新一居然會(huì)出現(xiàn)在這里，然而，和葉卻揭穿了這個(gè)家伙的真實(shí)身份。