當(dāng)晚發(fā)生殺人案件的書(shū)房是完全的密室，而屋外的雪地上也沒(méi)有腳印。犯人是怎樣到書(shū)房的呢？在大家都將兇嫌箭頭指向搞外遇的妻子和情夫時(shí)，柯南卻看出破綻。一樁多年前的恩怨所埋下了憤恨的殺機(jī)的事實(shí)漸漸浮出了水面。最終柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的犯罪手法并將其公之于眾，而兇手也最終承認(rèn)了因?yàn)槊妹玫娜ナ蓝饸⒛畹氖聦?shí)。

這天小五郎帶著小蘭和柯南到外面吃完飯時(shí)巧遇大學(xué)時(shí)代的同學(xué)大村。因?yàn)橛惺律塘克麄円煌搅舜蟠宓墓?。在屋里喝茶說(shuō)話時(shí)，窗戶玻璃突然碎了而在樓下的馬路上突然有個(gè)男人倒地身亡。在警方調(diào)查下發(fā)現(xiàn)死者生田是在和同學(xué)聚會(huì)的途中出去后死亡的。而在勘察了現(xiàn)場(chǎng)之后柯南發(fā)現(xiàn)了犯人使尸體自動(dòng)摔下的手法并以小五郎的聲音揭露了犯人的犯罪手法。犯人最終承認(rèn)了罪行并坦白了自己殺人的原因。

柯南隨小五郎參加「名偵探小五郎推理公館」電玩游戲的發(fā)布會(huì)時(shí)，碰到了游戲制作公司滿天堂的三名員工中島、上田和竹下，三人慌亂的存放行李后，趕往會(huì)場(chǎng)，期間，柯南偶然聽(tīng)到一高大黑衣男子的通話，并從中得知此人和黑衣組織有關(guān)，可還沒(méi)能得到更多的信息，黑衣人就被炸死，一番推理后，柯南發(fā)現(xiàn)這是意料之外的殺人事件，柯南能否得到更多的關(guān)于黑衣組織的線索？

小五郎骨折住院，某天夜晚他看到對(duì)面的房間有殺人的黑影，匆忙趕去后，卻發(fā)現(xiàn)屋里什么都沒(méi)有，接下來(lái)的幾天，發(fā)生了同樣的事情，主治醫(yī)師白井說(shuō)可能是因?yàn)槠诙a(chǎn)生的幻覺(jué)，但柯南卻認(rèn)為事件沒(méi)那么簡(jiǎn)單，他陪夜的當(dāng)晚也看到了殺人場(chǎng)景，兩人一起跑出去，當(dāng)他趕到小五郎身邊時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)小五郎已昏倒，旁邊還躺著已經(jīng)死去的江藤醫(yī)生，小五郎就這樣糊里糊涂的成了「殺人兇手」……

新一遭到某人綁架到白色房間，而且被迫回想起許多過(guò)去發(fā)生的案件。新一好像突然想到什麼，對(duì)著小蘭說(shuō)”這一切都是你做的”?？墒蔷驮诖藭r(shí)，兩人突然被玻璃隔開(kāi)，房間里放出白色的煙霧，不久後兩人都失去了意識(shí)。當(dāng)新一醒來(lái)的時(shí)候，已經(jīng)離開(kāi)白色房間，而且在現(xiàn)場(chǎng)有很多警察。第一個(gè)反應(yīng)就是要找小蘭的他，卻發(fā)現(xiàn)法醫(yī)站在小蘭身邊，而且後來(lái)還告訴她小蘭已經(jīng)死掉的消息...