在柯南與少年偵探團(tuán)的孩子們及阿笠博士看比賽歸途的電車內(nèi)，支持者赤野被殺。犯人確定在3個人之中。卻沒有決定性的線索。柯南從哀收看的比賽轉(zhuǎn)播中得到提示，看穿了犯人的謊言。并揭穿了犯人其實沒有看比賽只是通過廣播收聽比賽過程的謊言。而犯人也道出了為被赤野殺掉的弟弟報仇的動機(jī)。而此時柯南發(fā)現(xiàn)灰原遠(yuǎn)離人群，追過去后只看到列車奔馳而去？

柯南去看望同學(xué)片岡純，結(jié)果被人誤認(rèn)為是純而遭到綁架。很快，綁架犯吉澤正向純的父親片岡茂電話要求贖金3千萬圓。并且指名交付贖金的必須是片岡的再婚的對方江崎幸子。吉澤在公園得到放有幸子送去的贖金的蜂蜜便當(dāng)，乘輕四輪車逃走。但是，在警察的追蹤中，車子突然消失在隧道里！

與黑色組織面對面 滿月之夜的兩起神秘事件(之五)柯南昏倒，茱蒂受傷，蓓摩特的槍口指向灰原，千鈞一發(fā)之刻，一直躲在后車廂的小蘭突然沖出來，緊緊抱著灰原，面對這種意想之外的狀況，蓓摩特想起了往事而不忍下手，趁她分神的時候，與茱蒂同屬FBI的赤井秀一出現(xiàn)，雖然保護(hù)了無辜的人，但蓓摩特卻以柯南為人質(zhì)成功逃脫。途中柯南從昏睡中蘇醒，接下來就是柯南與蓓摩特的單獨對峙，他能否根據(jù)蓓摩特的電話找出黑暗組織的boss？

朱蒂準(zhǔn)備辭去學(xué)校英語老師工作回美國。小蘭和園子為朱蒂舉辦了送別晚會，在去找中學(xué)同學(xué)七川的時候卻發(fā)現(xiàn)她正被打工的便利店里的訓(xùn)斥。為了洗清朋友小偷的嫌疑，小蘭她們開始尋找沒有留下一點痕跡的小偷。但是從監(jiān)控錄像和店長的證詞中都沒有小偷的蹤影，而店長也準(zhǔn)備把七川送到警察局！

步美有個朋友答應(yīng)送給她豪華的七段裝飾人偶，因此步美約柯南等人來到此人家中。正巧同幢公寓里住的津曲水貴與古董鑒定師三重芳春也來到這戶人家，希望主人能轉(zhuǎn)讓一幅價值數(shù)千萬的壁畫。女主人觀野節(jié)子和繼母彌生拒絕了2人的請求，但就在主人外出后，那幅壁畫失竊了。在警方的調(diào)查下少年偵探團(tuán)的各位發(fā)現(xiàn)了現(xiàn)場的些許的不自然的地方!