工藤收到屋田誠(chéng)人的信，信上說他一年前辦的案子有差錯(cuò)讓他重新調(diào)查，于是，在服部、小五郎等人的陪伴下他們一起前往那個(gè)村莊。柯南只身來到了信上所說的地址，不想被關(guān)進(jìn)了小木屋，就在這時(shí)，他因?yàn)檎`食解藥的身體開始發(fā)生變化，逃脫期間掉進(jìn)了旁邊的湖里，被人發(fā)現(xiàn)時(shí)他已經(jīng)失去記憶。為了讓他想起過去，服部一行帶著新一來到了當(dāng)時(shí)的案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)日源村長(zhǎng)家，并在這里碰見了記者河內(nèi)深里以及屋田誠(chéng)人的同學(xué)水川萌生。

阿笠博士和少年偵探團(tuán)一起去看sprite的球賽，然而在最后關(guān)頭sprite卻輸?shù)袅吮荣悾谑牵恍腥藥е吐涞男那榍巴儇浌荆驗(yàn)殡y以接受事實(shí)而獨(dú)自一人留下，可在踢球的時(shí)候因摔倒而短暫暈厥過去，待他醒來?yè)烨虻臅r(shí)，卻發(fā)現(xiàn)了之前在停車場(chǎng)結(jié)識(shí)的德國(guó)人滿頭是血，讓人疑惑的是他在陷入昏迷之前一直指著元太，所幸柯南破解了他留下來的訊息并將嫌疑人鎖定在三人之中。

柯南在和大家一起吃壽司的時(shí)候?qū)⑿∥謇陕樽恚?dāng)面戳穿了前來領(lǐng)獎(jiǎng)的兩名冒牌貨，幫胡桃找到了記憶中的少年。雖然這件事情成功解決，但是十五年前的連續(xù)殺人案卻依舊找不到眉目，案件將在三天后失效，可目前追查兇手的線索卻只有有兩條。在柯南一行人去步美家玩的時(shí)候，灰原說自己在這棟公寓里遇見了一個(gè)穿著大衣吹著口哨的男人，難道十五年前的殺人兇手出現(xiàn)了？

茱蒂老師以卡梅隆搜查官女朋友的身份出現(xiàn)瞞過了木暮警官，這時(shí)，警方找到了一個(gè)裝有雨衣和兇器的紙袋并且還在死者的便簽本上發(fā)現(xiàn)了一句疑似死亡訊息的話，根據(jù)這些線索，就連第一個(gè)發(fā)現(xiàn)尸體的女秘書也成了懷疑的對(duì)象。另一方面，水無憐奈雖然重新回到黑暗組織，卻遭到組織的懷疑，為了證實(shí)她是否被FBI所籠絡(luò)，組織派給她一件任務(wù)，那就是殺掉赤井秀一。

東西南北四個(gè)代表簡(jiǎn)單做了自我介紹以后，就各自回房休息，吃飯的時(shí)候卻發(fā)現(xiàn)導(dǎo)播被人綁在形如密室的房間內(nèi)，所幸生命沒有受到威脅，就在大伙兒忙著尋找線索時(shí)，照顧他們起居的甲谷突然說這是比賽的第一題，北部代表越水七規(guī)承諾一小時(shí)之后就能重現(xiàn)密室手法，等待期間南部代表時(shí)津潤(rùn)哉說起了一年前的薰衣草殺人事件。時(shí)間一點(diǎn)點(diǎn)過去，越水遲遲不現(xiàn)身，待大家趕到時(shí)，他已死在了密室中。