當(dāng)大家趕到神像處時(shí)，榮造早已氣絕身亡，聞?dòng)嵹s來(lái)的警察也迅速介入調(diào)查，當(dāng)前唯一可以確定的是，兇手就在當(dāng)時(shí)搭乘纜車(chē)的人之中，柯南注意到了山下的工人休息室便趁大家不注意的時(shí)候跑去調(diào)查，卻在這里發(fā)現(xiàn)……有了這樣?xùn)|西，一切謎題迎刃而解，他提出讓大家再次搭乘纜車(chē)以場(chǎng)景重演的建議，并麻醉小五郎說(shuō)出了事情的真相。

柯南和少年偵探團(tuán)幾天來(lái)一直覺(jué)得元太的舉止怪怪的，便追問(wèn)元太，元太說(shuō)他因?yàn)槟繐袅诉B續(xù)搶劫案的罪犯而正被追殺，這時(shí)從商場(chǎng)頂樓有鐵材向元太落下來(lái)讓原本以為只是元太想多了的柯南眾人也認(rèn)真起來(lái)了。元太聲稱(chēng)見(jiàn)到連續(xù)強(qiáng)盜犯卻忘記在哪里看到的。在不斷的回憶前幾天的事情之后少年偵探團(tuán)的各位終于找到元太看到盜賊犯。

柯南在從大阪回來(lái)的新干線(xiàn)中遇上了佐藤警官、高木警官。兩人正在押送毒品的秘密販賣(mài)者小倉(cāng)。途中車(chē)內(nèi)發(fā)現(xiàn)可疑的炸彈包裹。就在佐藤前去查看之時(shí)留下高木警官的時(shí)候，犯人小倉(cāng)要求去廁所，卻在廁所中用刀刺自己的腹部身亡。而在調(diào)查的過(guò)程中佐藤發(fā)現(xiàn)小倉(cāng)血跡的疑點(diǎn)，并推斷出這是他殺時(shí)間而非自殺。

備前千鶴在飯店房間里上吊，因而被眾人認(rèn)為是自殺。在柯南的啟發(fā)下小五郎發(fā)現(xiàn)千鶴是他殺的肯能性。在警方的詢(xún)問(wèn)下眾人都有殺害千鶴的肯能。在調(diào)查飯店的屋頂之后柯南發(fā)現(xiàn)了犯人飛翔一般的作案手法和留下的證據(jù)。在證據(jù)面前兇手最終承認(rèn)了罪行，同時(shí)道出了和千鶴和自己弟弟的過(guò)往以及殺害她的原因。

某天突然神秘女子池波來(lái)到事務(wù)所說(shuō)要尋找中學(xué)同學(xué)柴田。通過(guò)池波提供的照片小五郎很快就找到了柴田，他們一行人立刻去了柴田家。就在進(jìn)入池田家的時(shí)候卻發(fā)現(xiàn)池田已經(jīng)被殺害而死時(shí)手里捏著的正式池波年輕時(shí)的照片！而柯南對(duì)這位委托人不夠完美的說(shuō)詞充滿(mǎn)了疑問(wèn)。在不斷的調(diào)查中柯南發(fā)現(xiàn)神秘女子的疑團(tuán)不斷增多，池波究竟是何方神圣？