千葉警官在警局四處詢問(wèn)有關(guān)“不明飛行物”的線索，卻毫無(wú)所獲，這天他回到家，收到了聲稱是自己宇宙第一大粉絲的人寄來(lái)的神秘郵件。在另一邊，名為和田陽(yáng)奈的女高中生來(lái)到毛利事務(wù)所，委托小五郎調(diào)查杯戶公園“UFO”一事。杯戶公園隔壁的杯戶高中發(fā)生殺人案件，這兩者是否有聯(lián)系？

利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開(kāi)暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開(kāi)了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？

音樂(lè)人波土祿道發(fā)表了新歌并準(zhǔn)備召開(kāi)演唱會(huì)，柯南等人約定一起去看波土的彩排表演。來(lái)到表演廳外的眾人偶遇了波本和小梓，卻被工作人員通知表演臨時(shí)取消。正當(dāng)眾人在表演廳外交談時(shí)，前來(lái)做消防檢查的警察卻突然發(fā)現(xiàn)波土祿道被吊死在了舞臺(tái)正中央……

小五郎帶蘭和柯南來(lái)到東京附近的度假山莊放松，在那里遇到了同樣來(lái)休閑的女大學(xué)生三人組。小五郎伴著美景喝了許多酒，正當(dāng)他昏昏欲睡之時(shí)，河邊突然出現(xiàn)了異變。河水突然變紅，順?biāo)戮尤挥幸痪呤w飄了過(guò)來(lái)，小五郎立刻清醒跳河救人，等打撈上來(lái)后大家驚覺(jué)這居然是剛才的女大學(xué)生之一的秋葉夕子。

平次與和葉邀請(qǐng)小蘭和柯南一起去看彩燈，在等小蘭與和葉準(zhǔn)備晚飯的期間，平次和柯南去樓下的白羅咖啡館打發(fā)時(shí)間，不料卻恰好遇到了一起殺人未遂的案件。受害者雖沒(méi)有生命危險(xiǎn)，但血跡卻濺到了柯南和平次的臉上，二人本以為可以通過(guò)血跡找到真兇，萬(wàn)萬(wàn)沒(méi)想到店內(nèi)的幾個(gè)客人身上均未發(fā)現(xiàn)血跡。正當(dāng)案件調(diào)查一籌莫展時(shí)，店內(nèi)一名自稱和田進(jìn)一的男子突然念起一首和歌，平次和柯南馬上明白了此人的用意，并合力找出了真兇。