警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴男躲在一個倉庫里，不知為何柯南與小五郎也在場。警方突破倉庫門進入準備抓捕嫌疑人時，鷹取嚴男打開事先設下的陷阱，趁現場混亂之時綁架了柯南當做人質逃跑?？履显诜溉塑嚿纤艡C逃跑，不料卻跑進死胡同里被抓。無奈之下柯南被帶到了一個荒廢的倉庫里，犯人鷹取嚴男究竟想讓柯南做些什么？

千葉警官在警局四處詢問有關“不明飛行物”的線索，卻毫無所獲，這天他回到家，收到了聲稱是自己宇宙第一大粉絲的人寄來的神秘郵件。在另一邊，名為和田陽奈的女高中生來到毛利事務所，委托小五郎調查杯戶公園“UFO”一事。杯戶公園隔壁的杯戶高中發生殺人案件，這兩者是否有聯系？

柯南跟著步美等人調查他們目擊犯人的樓層，圣誕節的百貨商場人流量非常多，他們三人在目擊犯人時都沒有看到犯人的臉，綜合他們當時所遇到的場景柯南有了線索。步美等人的證詞都沒有錯誤，出現不一致的原因是外觀印象會受到周圍環境的影響，而綜合這些證詞后符合條件的人只有一個。

柳龍和蕭塵宇找到唐三和小舞，柳龍對唐三出言不遜，唐三使出控鶴擒龍的絕招襲擊柳龍，他疼地大呼小叫，蕭塵宇假惺惺向小舞賠罪，要把小舞帶回去當寵物兔養，小舞剛想發作，唐三急忙攔住她。蕭塵宇逼唐三把小舞交出來，然后加入他的武社，唐三斷然拒絕，蕭塵宇下令活捉那只幼小的斑斕貓，沒等柳龍出手，唐三炮突然出現，后面緊跟一條曼陀羅蛇，把蕭塵宇和身邊的侍衛打得七零八落，小舞趁機攙著唐三逃走。玉小剛突然出現，讓唐三和小舞跟緊他，以免再遇到麻煩，小舞一心想回去救那只受傷的斑斕貓，玉小剛勸她趁早死心，他發現斑斕貓被曼陀羅蛇咬傷，就順著痕跡找到蛇的巢穴，讓唐三炮把蛇激怒，引到了蕭塵宇他們身邊，才讓唐三和小舞得以脫身。玉小剛覺得這條曼陀羅蛇很適合唐三，讓他把蛇殺死吸取魂環，小舞提出質疑，唐三對玉小剛深信不疑。玉小剛想等蕭塵宇和蛇兩敗俱傷的時候出手，蕭塵宇和柳龍漸漸不敵，他們嚇得落荒而逃，曼陀羅蛇突然襲擊了玉小剛，玉小剛讓唐三出手殺蛇，唐三上下翻飛，使出暗器鐵釘襲擊蛇，結果被打翻在地，唐三使用紫金魔瞳刺瞎蛇的眼睛，然后再用鐵釘刺穿了蛇的喉嚨，曼陀羅蛇應聲倒地死亡，頭頂上現出黃色的魂環，唐三知道這條蛇至少有400年的法

一直被大家遺忘在家中的狗引起了柯南與平次的注意，二人很快就洞察了這一系列殺人事件的作案手段。平次委托村長告訴眾人他已經得知了鵺的真面目，并在庭院內為眾人重新演示了一遍案發當日的情形。在二人的推理下真相終于浮出水面，兇手成功被警方抓獲。當案件塵埃落定后，平次終于鼓起勇氣準備向和葉告白……