為了陪光彥把壓歲錢(qián)存進(jìn)賬戶(hù)，柯南、步美和灰原等人一起來(lái)到帝都銀行，可元太因?yàn)槌蕴辔竿戳似饋?lái)，就在博士和灰原外出買(mǎi)藥期間，一波帶著面具的搶匪突然闖進(jìn)銀行，前來(lái)取錢(qián)的茱蒂老師以及一名貌似赤井秀一的人也成為了他們的人質(zhì)，雖然茱蒂用美人計(jì)在廁所獨(dú)立擊倒一名搶匪，卻不幸被同伙發(fā)現(xiàn)，事已至此，少年偵探團(tuán)成為了將徒制服的唯一希望！

大家二次來(lái)到倉(cāng)庫(kù)后發(fā)現(xiàn)了在門(mén)上方供奉著的神壇，而讓柯南更為好奇的是神壇對(duì)面的大算盤(pán)，這很可能是啟動(dòng)機(jī)關(guān)的鑰匙，仔細(xì)觀察倉(cāng)庫(kù)之后，柯南發(fā)現(xiàn)了其中的蹊蹺，他叫來(lái)警察與他一起根據(jù)灰塵的多少撥動(dòng)算珠，果不其然，天花板漸漸向下移動(dòng)，警察不僅在這里找到了被盜的寶物還抓住了偷盜者，案件結(jié)束后，柯南揪出了那個(gè)一直暗中幫助元太他們的“軍師”，而這個(gè)人正是……

小五郎和警察立刻對(duì)與死者有關(guān)的人士展開(kāi)偵訊，雖然三個(gè)嫌疑犯都很有犯案的動(dòng)機(jī)，可是卻苦于找不到證據(jù)而且殺人手法也難以破解，當(dāng)晚，柯南發(fā)現(xiàn)了小五郎早早就準(zhǔn)備好放在枕頭底下的禮物，并且還從他的夢(mèng)話得到了啟示。為了給小五郎在這個(gè)特殊的日子提供表現(xiàn)的機(jī)會(huì)，柯南暗中提醒，所幸小五郎一點(diǎn)就通知道了兇及其犯案的手法。案件結(jié)束后，小五郎深情款款拿出禮物，可是這個(gè)迷糊的偵探卻記錯(cuò)了日子。

小五郎受到一個(gè)名叫立李三可的委托，帶著柯南和小蘭一起來(lái)到群馬縣調(diào)查真相，途中他們遇見(jiàn)了德備六朗和荒巖，并從他們口中得知了11年前有一個(gè)名叫辰彥的孩子在旅館附近的河中溺斃而亡的事件，這與信中所提及的殺人案有何聯(lián)系？辰彥父親同時(shí)也是約見(jiàn)地點(diǎn)光羅旅館的老板沼山伴藏也讓人覺(jué)得很怪異，次日清晨，滿(mǎn)身都是刺鼻氣味液體的伴藏死在了旅館的頂樓房間，難道是小蘭昨晚在河邊看到的河童下的毒手嗎？

灰原要求查看電視臺(tái)在黑暗中拍攝的影像，然而除了電流被切斷的聲音和風(fēng)聲并沒(méi)發(fā)現(xiàn)有任何異樣，就在案件找不到頭緒時(shí)，大人們便開(kāi)始互相懷疑，這時(shí)，柯南蘇醒過(guò)來(lái)，但是他讓元太他們對(duì)此事暫時(shí)保密，根據(jù)基德在臺(tái)座上貼的卡片，柯南知道了右衛(wèi)門(mén)刻在柱子上的話以及基德的真身，他讓少年偵探團(tuán)戳穿他的身份，這一次基德能否成功脫身？