小林老師在圖書館里發(fā)現(xiàn)了一個牛皮錢包，那里放了小學一年級時小蘭留的字條。事情追溯到十年前，為證實謠言的真假，小蘭和新一夜訪校園，不想?yún)s在學校圖書館遇到了一個自稱是新一弟弟的神秘男子，他向新一發(fā)出挑戰(zhàn)并在留下了一個裝有暗號的牛皮錢包后離開。于是，新一和小蘭二人就在阿笠博士的幫助下展開了解謎暗號的尋寶之旅！

服部、和葉來到東京與柯南他們賞櫻的時候，一名來自升岳寺的小和尚突然找到小五郎拜托他調(diào)查一件古怪的事情，他說幾天前寺里來的一個女施主腹部刺傷血流遍地的倒在別館里，但當他叫師父和警察來時，屋內(nèi)卻空空如也。于是，柯南，服部等人一同前往調(diào)查，除了在屋內(nèi)發(fā)現(xiàn)耳環(huán)固定夾再沒有別的線索，就在他們離開之前小和尚傳久說屋里又有女尸，待柯南趕到時，卻什么也沒有，難道這都是傳久的幻覺？

警察在案發(fā)現(xiàn)場發(fā)現(xiàn)了一個筆記本，上面以流動日記的形式寫著這四名死者害死甲斐先生的秘密，根據(jù)這個筆記本，大和警官推測兇手就是因為內(nèi)疚而動手殺人的繁次。但是還有疑點并未解開，于是，柯南和服部兩人再次來到了綾華的死亡現(xiàn)場，并從一名警察那里聽到了關(guān)鍵的線索，兇手就是……

服部打電話告訴柯南雖然沒有查到水無憐奈的過去，但是找到了關(guān)于神秘轉(zhuǎn)學生本堂英祐的事情，于是，柯南根據(jù)服部所提供的情報和阿笠博士、灰原來到了據(jù)說有英祐父親照片的模型店店長的家中，可是，店長卻發(fā)現(xiàn)柯南要找的照片突然不見了，并且根據(jù)房中所留下的痕跡來看，柯南斷言一定有人曾入侵過這個房間。

服部平次vs工藤新一 滑雪場的推理對決(上集)2平次和柯南打電話的時候，講起了自己在初中時期遇到的一個未曾謀面的勁敵。當時，平次和同學們一起來山里滑雪，不想遇見一起命案，而死者正是著名演員箕輪獎兵，這起案件與四年前曾在這里發(fā)生過的命案極其相似，受害者都是死在纜車上并且身邊的背包里全是雪。在調(diào)查過程中，服部總會從別人口中聽到一個同樣參與破案的初中生，而這個人正是工藤新一，服部不由和這個“隱形”對手較起了勁。