高木警官和佐藤警官瞞著警局里的同事們，偷偷在熱帶樂(lè)園的水世界見(jiàn)面，為了阻撓他們的約會(huì)，警局的同事們暗中搗鬼，安排柯南，光彥等人出現(xiàn)在他們面前，就在這個(gè)時(shí)候，高木警官原本裝有求婚戒指的包居然出現(xiàn)毒品，之后，他意識(shí)到這一定是在搭乘“海地五萬(wàn)里列車”時(shí)被人調(diào)了包，柯南根據(jù)這個(gè)包包的肩帶判斷出他的主人是個(gè)左撇子，并根據(jù)當(dāng)時(shí)所拍攝的照片和游客所填寫的信息表，將目標(biāo)鎖定在一個(gè)叫高城登的人身上。

與黑色組織面對(duì)面 滿月之夜的兩起神秘事件(之二)灰原一人在家等新出醫(yī)生接她看病的時(shí)候，茱蒂老師居然出現(xiàn)在門外。另一邊，幽靈船上的宴會(huì)剛開(kāi)始，船長(zhǎng)就被不明人士用十字弓射殺，而在他的胸前還出現(xiàn)了一張惡魔牌，在對(duì)工作人員進(jìn)行詢問(wèn)之后，小五郎認(rèn)為兇手就是與自己一組的但將惡魔牌遺失的木乃伊，以此同時(shí)，和小五郎同組的隱形人獨(dú)自一人展開(kāi)了調(diào)查，并且還發(fā)現(xiàn)了不少線索，他利用廣播將船艙內(nèi)的客人叫的甲板，在揭秘兇手及其犯案手法之前，他拆掉了自己的偽裝……

某個(gè)星期日，柯南和小五郎在樓下喝咖啡的時(shí)候，從店員阿紫那里聽(tīng)到了一件奇怪的事情，一位客人用完餐之后將手機(jī)落在了店里，期間，阿紫曾接到過(guò)三通電話，最奇怪的就是最后一次，柯南和小五郎查看手機(jī)，發(fā)現(xiàn)這里面所存的號(hào)碼和名字全部都是虛假的，就在二人毫無(wú)頭緒的時(shí)候，由美拿著這家店的發(fā)票找到這里，而這些發(fā)票的持有者正是手機(jī)的主人，由美說(shuō)這個(gè)人已經(jīng)出車禍死亡，為了調(diào)查事情的真相，柯南建議給電訊公司打電話查詢。

柯南在新出醫(yī)院遇到的老先生說(shuō)了一段讓人匪夷所思的鬼怪理論，為了探求真相，柯南等人來(lái)到了這棟有鬼出沒(méi)的公寓，在其旁邊還有一棟因人自殺而停工的公寓，正前方的公園也曾現(xiàn)過(guò)一具女性的焦尸，這些傳聞聽(tīng)著就叫人毛骨悚然。當(dāng)晚，大家在老先生的房中等鬼出現(xiàn)時(shí)，卻不知不覺(jué)都睡著了，恍惚中，電視自己打開(kāi)并出現(xiàn)了恐怖畫面，而馬桶的水也突然變成紅色，窗外還出現(xiàn)了鬼影，難道這棟公寓真的有鬼？如果這一切都是人為，那么他又有什么目的呢？？

柯南與少年偵探團(tuán)與阿笠博士去看足球比賽。在歸途中，遇見(jiàn)在看電視轉(zhuǎn)播其他比賽的赤野，他毒罵比賽中轉(zhuǎn)會(huì)而遭觀眾噓聲的選手。赤野是上了看球黑名單惡名昭著的狂熱不良分子。然而這個(gè)赤野在支持者混雜的電車內(nèi)被殺害了。在柯南等各位少年偵探團(tuán)的幫助下警察很快排查出了主要的嫌疑人。而就在此時(shí)灰原卻默默的走離人群？