柯南、少年偵探團(tuán)、哀、阿笠博士來到阿笠博士友人所在村莊觀光，在夜晚的溪邊等待放螢火蟲時(shí)，村長的兒子中嶺和助手垂水乘坐運(yùn)送螢火蟲的貨車到達(dá)。垂水打開貨車上的箱子，螢火蟲便成群結(jié)隊(duì)的飛了出來。元太為了要抓螢火蟲，爬上了貨車，隨手拿走了貨車上的手電。在大家陶醉于欣賞螢火蟲時(shí)，助手垂水接到一通中嶺打來的電話，說中嶺在烏帽巖，救命。柯南等人到達(dá)時(shí)，發(fā)現(xiàn)中嶺已經(jīng)死在車內(nèi)，地上放著疑似有毒的飲料瓶，車內(nèi)還飛著一只……螢火蟲。。。

鈴木次郎吉宅邸中的大保險(xiǎn)柜——鐵貍是由幕末的機(jī)關(guān)師三水吉右門衛(wèi)制造的無法攻陷的最強(qiáng)保險(xiǎn)柜。針對(duì)鐵貍，怪盜基德拋出了挑戰(zhàn)書，揚(yáng)言自己將打開那個(gè)擊退了無數(shù)盜賊的堅(jiān)固門扉，然而在鐵貍外，次郎吉還安裝了與重量傳感器聯(lián)動(dòng)的防盜裝置，任誰想要接近保險(xiǎn)柜都極其困難。在預(yù)告作案的當(dāng)天，中森警官率領(lǐng)警隊(duì)進(jìn)行了嚴(yán)密的布防，可是基德的第二封預(yù)告信還是出現(xiàn)在了保險(xiǎn)柜前，難道他已潛入宅邸？

小五郎、柯南和小蘭去鐮倉看繡球花的時(shí)候遇見了一樁命案，死者是資產(chǎn)家矢口九衛(wèi)門，警方立刻聯(lián)系了死者的兒子祿郎、明彥和公夫，分別對(duì)他們進(jìn)行偵訊，發(fā)現(xiàn)每個(gè)人都有作案動(dòng)機(jī)和嫌疑，但他們卻有不在場的證明。死者的三個(gè)兒子不但沒有為父親的死感到悲傷反而因?yàn)檫z產(chǎn)分配問題爭吵不休，看透真相的柯南將小五郎麻醉道出老先生的死因以及一個(gè)父親的哀傷。

最有可能犯案的就是第一個(gè)沖進(jìn)房間的染井社長，于是，高木打電話給公司，其中有同事表示曾在案發(fā)時(shí)間見過染井出入藥店，而這件事也從藥店員工那里得到了證實(shí)，這無疑是染井?dāng)[脫嫌疑的最好證明，可他為何只字不提？之后，柯南又注意到了桌子上的蛋糕，在他的提醒下，高木還原了被偽裝的案發(fā)現(xiàn)場，事已至此，染井主動(dòng)承認(rèn)自己的罪行，但柯南卻指出兇手另有其人。

死者鍛吾是被人捆綁溺斃在泳池中而死，他的一只手上還戴有前管家的手套，作為父親的角藏認(rèn)為兇手就是這棟宅邸中的某個(gè)人，聞聽此言，小五郎便做出不可能是家人犯案的結(jié)論，可是當(dāng)晚，角藏的房間里就傳出花瓶摔碎的聲音，當(dāng)大家趕到時(shí)，角藏已上吊身亡，在案發(fā)現(xiàn)場高木警官發(fā)現(xiàn)疑似角藏所留下的死亡訊息。