為了采集蘑菇少年偵探隊(duì)一行人全部進(jìn)了山里，忙著采菇的時(shí)候，元太竟然誤入狩獵區(qū)。無(wú)奈之下，大家只好兵分兩路分頭尋找，沒(méi)想到灰原和光彥居然發(fā)現(xiàn)被人獵殺的尸體，害他們自己反成了射殺的目標(biāo)。另一邊，找到元太之后，大伙兒便和三名獵人一起沿著山區(qū)的小路尋找灰原和光彥的蹤影。

柯南眾人手表雖然找到了，但在護(hù)田家看MP4電影的出月被殺害了。柯南確信護(hù)田就是兇手，在調(diào)查了錄影帶機(jī)附近之后終于找到犯人利用錄影帶機(jī)而用花瓶砸暈出月的事實(shí)。而與此同時(shí)警局內(nèi)有關(guān)毛利的卷宗全部被翻閱過(guò)的事實(shí)讓柯南驚覺(jué)自己是不是被黑衣人組織再次盯上了。在解決時(shí)間之后柯南匆忙回到事務(wù)所發(fā)現(xiàn)屋內(nèi)空無(wú)一人原來(lái)只是虛驚一場(chǎng)。

少年偵探團(tuán)在超市里玩從收銀條上的物品名稱猜晚飯的菜名的游戲。其中發(fā)現(xiàn)了可疑的收銀條，柯南她們開始尋找買這些東西的人，想要阻止他。通過(guò)分頭尋找自行車燈少年偵探團(tuán)的成員們最終找到了犯人，但中途卻失去了犯人的行蹤。在元太無(wú)意的提醒下，柯南他們抓到犯人現(xiàn)行。最終柯南用腳力增強(qiáng)鞋制服了犯人。

小五郎詢問(wèn)阿稔有關(guān)郵票的事情卻得到郵票已經(jīng)不見(jiàn)了的回答，柯南也明白了小蘭看到的拄拐杖的老人的影子和埝被古琴毆打的真相。而柯南也指出春菜收到的音樂(lè)盒其實(shí)是秋悟托付給他人送出的。鬧鬼的屋子的真實(shí)原因其實(shí)是有人背后操作。而秋悟先生的音樂(lè)盒其實(shí)也只是一般的旅游紀(jì)念品而已，真正貴重的是隱藏在音樂(lè)盒里暗語(yǔ)所指示出的郵票。

某日，一個(gè)叫上田丈二的醫(yī)師找到小五郎，拜托他調(diào)查自己的朋友吉村遭到不明人士恐嚇的事情，當(dāng)他們來(lái)到吉村所在的公寓剛準(zhǔn)備上樓時(shí)，突然聽到有東西墜落的聲音，柯南急忙跑去，卻發(fā)現(xiàn)吉村的尸體，目暮警官趕來(lái)之后，對(duì)吉村的公寓進(jìn)行了仔細(xì)的調(diào)查，而柯南卻將注意轉(zhuǎn)移到了住在六樓的上田身上。