小蘭和小五郎按照指示來(lái)到了車(chē)站，就在這時(shí)阿波羅發(fā)現(xiàn)了在車(chē)站里奇怪的男人并得到了接下來(lái)的線(xiàn)索U字。之后小蘭一行來(lái)到了接下來(lái)的提示的瓷器店而這時(shí)阿波羅和母親一起離開(kāi)剩下小五郎和小蘭繼續(xù)尋找線(xiàn)索。第二天在警方的要求下小蘭眾人繼續(xù)破解沒(méi)有完全解開(kāi)的暗號(hào)，而就在眾人解開(kāi)暗號(hào)來(lái)到會(huì)場(chǎng)之后，柯南發(fā)現(xiàn)賽場(chǎng)上的米奈芭有些不對(duì)勁！

阿笠博士和少年偵探團(tuán)在河灘看螢火蟲(chóng)的時(shí)候，垂水打電話(huà)給運(yùn)來(lái)螢火蟲(chóng)的中嶺，不想電話(huà)的另一邊卻傳來(lái)痛苦的呻吟聲，于是大伙兒匆忙驅(qū)車(chē)趕往事發(fā)地點(diǎn)，到達(dá)時(shí)中嶺已經(jīng)在自己的車(chē)子里停止了呼吸，在他的旁邊還有一瓶有毒的飲料，有四人具有犯案嫌疑小和田道武以及他的女兒小葵、垂水和達(dá)馬，就在鳴龍梳理案情時(shí)，柯南注意到了元太從垂水車(chē)上拿的手電筒，這正是破案的關(guān)鍵！

小五郎應(yīng)“草莓雙人組”中藤森朝子之邀前來(lái)參加她的慶生會(huì)，沒(méi)想到開(kāi)門(mén)的朝子小姐竟然一臉驚恐滿(mǎn)身是血的出現(xiàn)在小五郎面前，她說(shuō)有人突然闖入屋內(nèi)向她發(fā)動(dòng)襲擊，進(jìn)屋后，柯南發(fā)現(xiàn)了一具頭戴僵尸面罩的的尸體，而這個(gè)人正是朝子小姐的搭檔今岡次郎，警方把這起案件初步斷定為正當(dāng)防衛(wèi)，但柯南卻察覺(jué)到這是一起蓄意謀殺案！

園子的網(wǎng)球教練后藤貴雄即將參加比賽，為了給他加油打氣，園子和小蘭來(lái)到了北輕井沢，柯南去廁所的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)后藤與兩名女生糾纏不清。沒(méi)想到他在和園子進(jìn)行男女混合雙打時(shí)突然昏倒在球場(chǎng)上，警方介入調(diào)查并初步斷定后藤被人下了毒，由于鑒識(shí)人員在園子手套上檢測(cè)出毒物反應(yīng)，所以山村警官認(rèn)定園子就是兇手，為幫園子洗清冤屈，柯南又會(huì)有何行動(dòng)？

解決了暗號(hào)事件回到日本的柯南終于恢復(fù)了正常的生活，在放學(xué)回家的路上元太提議大家進(jìn)入即將拆遷的大樓內(nèi)來(lái)玩捉迷藏。就在這時(shí)元太發(fā)現(xiàn)有奇怪的敲打墻壁的聲音，柯南發(fā)現(xiàn)這是有人發(fā)出的求救聲音，就在他們?cè)谒褜さ倪^(guò)程中發(fā)現(xiàn)了在檢查大樓的兩個(gè)工人。兩人告訴柯南他們那是他們發(fā)出的響聲不用在意但在柯南的推理下少年偵探團(tuán)們開(kāi)始尋找被困的人，就在這時(shí)之前的檢查工人卻抓住了小哀，究竟應(yīng)該這應(yīng)該辦！