"1937年12月，隨著上海和南京的淪陷，浙東地區成為直面日寇的前哨，隨時面臨日寇的入侵。1939年，戰火蔓延到寧波和鎮海一帶。共產黨員蕭寒和江海生乘坐渡輪從上海到寧波，渡輪行至江心，蕭寒無意中發現船員們從水里打撈出一個大木箱，國民黨特派員張恒看到船員把大木箱抬走，才默默離開甲板，蕭寒和海生躲到一邊看得清清楚楚。中共寧波地下黨組織書記鄭英達接到上級密電，助理尹龍破譯出電文，他們才知道上級派來一名新同志明天就來到寧波，協助他們開展抗日武裝活動，電文還透露失蹤兩年的王茂林被關在寧波，鄭英達一直以為王茂林被暗殺了。日軍轟炸機從頭頂呼嘯而過，對寧波進行瘋狂轟炸，鄭英達擔心寧波淪陷，盼著新同志盡快趕到。張恒到甲板上吹風，蕭寒遠遠打量他的舉止做派，看出他是軍人。與此同時，日軍收到密電，明天上午九點，駐守寧波的軍政要員要去碼頭迎接重要人物。第二天一早，寧波碼頭戒備森嚴，國民黨第194師27團士兵楊秋草和付大虎等人奉命在這里站崗，渡輪徐徐開往寧波，鄭英達帶著尹龍早早來到碼頭，他們躲在接船的人群中。團長陳漢生和一營營長李滿彪帶兵提前來碼頭迎接特派員，林東野隨后趕來，他對李滿彪冷嘲熱諷一番。政工隊隊員胡子

回辦公室后，鄭翊安排下屬明日中午十一點在鮮花廣場通過王杰抓捕唐進義，并派人通知安德森，好讓“比基尼”第二階段順利進行，同時也安排局里其他一切正常運行。而俞北平正在家中回想著鄭翊晚飯時所說的話，當時他知道鄭翊要引林莎入圈套，特地隱晦地道出王杰的異常，也不知林莎是否能夠發現王杰的叛變。徐詠儀因為俞北平對林莎態度轉變突然，以為俞北平出軌愛上林莎，一時間傷心不已，暗自垂淚。第二日，俞北平來到特調局，程忠義因為完全相信了俞北平當初的說辭，便站在了他的那邊，將鄭翊要抓捕唐進義以及張炳坤等人研究遙控爆炸器的事情悉數告知于他。等程忠義離開不久，鄭翊正好進來通知俞北平準備抓捕唐進義。而此時，美方正催著清城局盡快將賓妮的案子結案，好抓到蘇聯違反雅爾塔協議的把柄。隨后，鄭翊、俞北平一行人前往鮮花廣場，嚴陣以待。程忠義按鄭翊命令通知安德森到現場一同抓捕王杰。臨近中午，唐進義的身影果然出現在了廣場附近。共黨察覺不對，便對暴露的國軍開了槍，局勢頓時一片大亂。事先安排好的國軍因此傾巢而出，將鮮花廣場團團圍住。一名共黨為掩護同志，吸引火力擊殺了叛徒王杰，之后便被國軍亂槍打死。而唐進義則趁亂躲在了俞北平所乘車輛的后備箱

吳昆才一向心高氣傲，怎能忍受同事如今的奚落嘲諷。在一段時間的隱忍后，吳昆才終于爆發，潛逃而出。他經過考慮后，決定轉而投靠美方，以求得自己的一席之地。鄭翊得知吳昆才逃出后，怒不可遏，忙派人搜尋。隨后，鄭翊在同俞北平商議結案事件時，行政處處長宋強趕來向她報告吳昆才正要同安德森見面，鄭翊嚴命宋強將吳昆才捉拿回來。而一旁的俞北平見狀，詢問此事，鄭翊便將南京下的密令皆告知于他。俞北平雖猜到約翰案同“比基尼”計劃脫不了關系，但從鄭翊處確認此事后，還是震驚非常。吳昆才搶先一步，順利見到了安德森，鄭翊和俞北平見此，只能聽天由命。吳昆才要求安德烈給自己安排美國人身份，但卻被安德森拒絕。見此，吳昆才便告知美方自己能弄到南京同蘇聯簽訂的秘密協議，想以此作為交換，美方欣然同意。吳昆才在美方的保護下，重回調查局。鄭翊和俞北平聯手審問他，吳昆才極力辯解，并道出自己打消了美方對國民黨方早就監控蔣維民一事的疑慮，但鄭翊和俞北平對他還有很深的懷疑。與此同時，安德森為保吳昆才，決定于明日發布公告，將吳昆才上調到《攻防部署》修改小組。俞北平審問完吳昆才回家后，正好看到徐丹妮在沙發熟睡。在給她蓋毯子的時候，俞北平無意間看見了

在跟徐詠儀談完后，林沖又找到程忠義詢問俞北平同林莎的關系。程忠義無奈之下，只能告知林沖林莎為共產黨的身份。謝楠等人最終被宋強帶人找到，兩方發生械斗，謝楠等人戰敗逃走。宋強等人雖帶回了吳昆才，但也有所傷亡，帶著吳昆才和舒曉梅兩人護照的小汪被共黨擊殺。吳昆才因為沒有護照，遲遲不肯離去，鄭翊忙趕來安撫他讓他先行離開，并再三保證護照必定會送到他們手上，吳昆才思量一番后最終答應。等鄭翊走后，吳昆才同舒曉梅坦言自己絕不會把照片乖乖交給鄭翊。同時，鄭翊等人推測出共產黨方運送黑索金設備的地點是魚浦頭涵洞，鄭翊派人封鎖涵洞，好抓住俞北平。謝楠逃脫后，回到醫院同俞北平見面，告訴他提吳昆才出來后發生的意外，而俞北平則推測出吳昆才的逃跑方式多半是船。鄭翊派孫德利送吳昆才等人到船頭，途中吳昆才下車到公共電話亭打了電話。等進了船，吳昆才一眼就看出船中都安插了特工。在敲打了孫德利兩句后，吳昆才告知孫德利那套照片就被放在中山公園石橋左起的第三塊花崗巖下，孫德利將美金和護照交給他，并讓吳昆才等鄭翊驗了貨后，方能離開。俞北平查出吳昆才乘坐的船只為浦達號，便派姜平叫孫德利帶人去抓捕他。姜平聽此，忙打電話通知鄭翊，不料卻被俞

吳昆才事關黨國機密，絕不能暴露在俞北平和美國人面前。鄭翊同陳雪明商量，由她去引開正在貨倉巡察的俞北平，而王科長則趁此機會讓吳昆才和舒曉梅進入后貨艙的貨柜，好將他們兩人運送出去。與此同時，正埋伏在魚浦頭的宋強接到月明灣美軍防區出現異動的消息，明白自己中了共黨的調虎離山之計，忙趕去月明灣。而林莎正在月明灣望風，被宋強抓個正著。鄭翊派人告知俞北平前艙有吳昆才的蹤跡，但這反而讓俞北平確認吳昆才很大可能在后貨艙內。由于國軍前線打仗急需該船上的這批貨物，俞北平只能松口讓檢查完的一批貨物先行運走。由于運送的這批貨物是最早貼上封條，所以封條本應該是干的，但在運貨物期間，俞北平發現其中一個貨柜的封條是濕的，他懷疑吳昆才就躲在此貨柜中，便攔截了這一貨柜，而事實正如他所料。吳昆才此時已被逼入絕境，只能舉手投降。鄭翊見吳昆才已無法逃出，只能安排狙擊手在吳昆才被押回美方的路上將其擊殺，從而避免吳昆才落入俞北平和美國人的手里。安德森很是憤怒，下令封鎖港口，務必找出兇手。遲又一找徐丹妮見面，他假裝自己為共產黨，表面上請徐丹妮利用她父親俞北平的身份為他獲取關于國黨高層的情報，實則就是讓徐丹妮監視俞北平。徐丹妮不疑有他