17年前日本將棋四冠王羽田浩司遇襲案讓柯南非常在意，和他同日遇害的還有同一酒店的美國資本家阿曼達(dá)，柯南和灰原推測這是組織所為，但羽田浩司遇害時(shí)的房間卻不像是組織的一貫風(fēng)格。地產(chǎn)公司社長被害時(shí)手里拿著阿笠博士發(fā)明的剪刀，目暮警官請阿笠博士來說明剪刀的用途看是否能為破案提供幫助，柯南注意到這次的案件卻與17年前羽田浩司遇害案非常相似。

為了和靈魂偵探堀田凱人進(jìn)行對談，柯南跟著毛利小五郎來到了酒店，但到時(shí)發(fā)現(xiàn)堀田已被殺害，其隔壁房間的客人竟然是世良。柯南和世良在案發(fā)現(xiàn)場進(jìn)行了一番調(diào)查，罪犯的手法與關(guān)鍵性的證據(jù)全被找了出來，就在柯南準(zhǔn)備和往常一樣進(jìn)行推理時(shí)卻發(fā)現(xiàn)自己的變聲器不見了，而這時(shí)竟有人很自然的用他遺失的變聲器開始模仿小五郎的聲音進(jìn)行推理。

柯南和平次傳來歷史學(xué)家的死訊，眾人陷入恐慌，并認(rèn)為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學(xué)家主動(dòng)要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細(xì)節(jié)，院子卻突然再次著火，與此同時(shí)樓上的考古學(xué)家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內(nèi)，待柯南等人趕到時(shí)已經(jīng)喪命。經(jīng)過一番調(diào)查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。

唐三忍著被電的劇痛，用藍(lán)銀草把鐵籠子的欄桿死死捆住，他拼盡全力往外拉，藍(lán)銀草一點(diǎn)點(diǎn)被電枯萎，唐三被電到口鼻出血，鐵籠子的欄桿才拉開一個(gè)大縫，唐三因?yàn)轶w力透支暈倒在地，小舞和玉小剛急忙從大縫里出來攙起唐三。唐三掙扎著爬起來，他試圖召喚藍(lán)銀草，結(jié)果無動(dòng)于衷，玉小剛勸他不要再浪費(fèi)力氣了，他的武魂已經(jīng)徹底廢掉了，蕭塵宇對唐三冷嘲熱諷，逼他俯首稱臣，玉小剛使出雙魂環(huán)，蕭塵宇根本不屑一顧，還取笑玉小剛是廢人，玉小剛讓唐三和小舞屏住呼吸，他召喚出沉睡的唐三炮，唐三炮跳起腳來沖蕭塵宇他們放了一個(gè)大煙彈，把蕭塵宇和柳龍等人當(dāng)場熏暈，蕭塵宇揚(yáng)言要追到圣魂村殺了他們，玉小剛惱羞成怒，返回來暴打他一頓，蕭塵宇嚇得連連求饒。玉小剛斷定蕭塵宇不會(huì)善罷甘休，唐三想回圣魂村把父親一起接走。王圣不肯放過這難得的報(bào)仇機(jī)會(huì)，把蕭塵宇一刀斃命。凌風(fēng)聞?dòng)嵹s來，看到蕭塵宇被割喉而死，就把昏迷的柳龍叫起來問明緣由，凌風(fēng)看到被掰彎的鐵籠子，得知此事是玉小剛，唐三和小舞所為，讓柳龍把在場的侍衛(wèi)都叫起來，一起去圣魂村追殺唐三他們，否則城主會(huì)讓所有人陪葬。唐三帶著小舞和玉小剛回到圣魂村，可唐昊不在家，玉小剛發(fā)現(xiàn)家具上落了厚厚的灰，猜到家里

警方分別對三位女當(dāng)事人進(jìn)行了詢問，并檢查了她們隨身攜帶的物品，而案發(fā)現(xiàn)場所發(fā)現(xiàn)的白色涼鞋成為了本案最大的疑點(diǎn)。在諸多線索的指引下，柯南和世良很快便推理出兇手的身份，但卻未能明白兇手的作案手段。最終在園子不經(jīng)意的提示下，柯南順利地將案發(fā)過程演繹給眾人，成功找出真兇。而兇手與死者之間，竟有這樣一段不為人知的往事……