高木警官完全沒有向任何人告知行蹤便獨(dú)自出了遠(yuǎn)門，在警視廳門前等待高木警官的少年偵探團(tuán)們遲遲等不來人，這時(shí)一個(gè)男人交給了他們一個(gè)說是高木警官送來的包裹。佐藤警官打開包裹后發(fā)現(xiàn)里面放著一個(gè)平板電腦，按下電源后看到的竟然是身處于危險(xiǎn)之中的高木警官，即便高木警官還保持著冷靜，但體力透支的他還能撐多久？

來到熊本阿蘇火山旅行的柯南等人不幸卷入了事件，盜取熊紋食品機(jī)密資料的犯罪嫌疑人試圖取回贖金時(shí)被步美打斷，藏有機(jī)密隨身碟的熊本熊玩偶陰差陽錯(cuò)到了小男孩賈斯丁手中，與賈斯丁有過一面之緣的柯南等人好不容易才找到了他的線索，但卻被犯人搶先了一步，現(xiàn)在丟失的不只是機(jī)密文件，連同賈斯丁也被綁架了。

被初音小姐雇傭的偵探安室透在調(diào)查伴場先生時(shí)發(fā)現(xiàn)了一件事，初音小姐和伴場先生都是從同一間飯店獲救的嬰兒，兩人都是在身份不明的情況下在同一所教會(huì)中撫養(yǎng)長大，聽到這些之后的初音非常在意。所有的證據(jù)都指向了伴場先生，在車底找到初音小姐掉落指甲的柯南似乎看出了事情的真相，這背后或許有著令人悲傷的事實(shí)。

少年偵探團(tuán)在幫助真央尋找小狗的時(shí)候遇到了千葉和高木，偽裝成小五郎聲音的柯南從目暮警官哪里得知了發(fā)生的事件，中午左右的兩起爆炸事件的嫌犯已經(jīng)抓住，但裝有最后一枚炸彈的狐貍宅便車卻被毫不知情的劫犯搶走，而真央的小狗正是在這個(gè)被劫走的車?yán)铩榱朔乐挂馔庠俅伟l(fā)生，柯南帶領(lǐng)著少年偵探團(tuán)們一起尋找車子的下落。

圍繞著由推理游戲急轉(zhuǎn)成的殺人事件，柯南在詢問過車內(nèi)有嫌疑的人后漸漸有了線索，事件背后的兇手終于露出了馬腳，正在他上演推理秀時(shí)卻有其他的事情發(fā)生。單獨(dú)出去的小哀至今未歸，而世良真純也被神秘人物電暈帶走，但這個(gè)車上還藏著不一般的人物，最后誰是贏家現(xiàn)在還沒有定論。