紀曉嵐從鴿子賣主口中得知鴿子可以傳信，聯想到和珅收購大量鴿子，紀曉嵐有所覺悟。趙青找到和珅，懇求其允許自己替哥哥考試。一曾經被紀曉嵐救助過的翰林將和珅收買眾翰林替考生答卷作弊并由鴿子傳送的消息透露繪紀曉嵐。紀曉嵐命小月在適當的時候燃放爆竹，以驅趕鴿群。趙青得知考生均要過“凈身池”很是擔心，她面露猶豫之色引起士兵的懷疑。正在兩人拉扯之時，紀曉嵐出現并堅決表示不會讓趙青進入考場。為了拉攏趙青為自己效力，和珅以趙青忠孝為由，懇請乾隆傳其入場，紀曉嵐卻以“無規矩不成方圓”為由大加反對。小月跟蹤和琳，發現了眾翰林答卷的密室，正當小月想要察看一番時，卻被和琳發現并打暈。小月醒來發現試卷已被鴿子帶走，便飛馬趕往考場。沒有小月的命令，等候放爆竹的人誰也不敢動手，眼睜睜地看著鴿群飛過。紀曉嵐將準備好的誘鴿放上天，鴿群在誘鴿的帶領下紛紛落地。小月趕到并下令放爆竹，結果鴿群受到驚嚇又再次飛上天，和珅幸災樂禍。得知自己高中，趙青深感愧疚，于大堂之上向乾隆揭露考試內幕。

京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

湘云出行未遠，即被書商陳未元劫持，原來二人本是夫妻，陳未元貪圖謀利，視“紅樓”奇貨可居，來日待價而沽。湘云曾為曹雪芹校訂書稿，深知其中三味，愛書心切，惟恐被毀，攜之東躲西藏，夫妻反目成仇。看來要使《紅樓夢》得見天日，只能借助于皇上了，紀曉嵐遣皇差向遠在泰安的皇上獻上了幾冊散裝的書稿，易名為《石頭記》，請太后、皇上消遣閱讀。或許是旅途苦悶，太后讀后愛不釋手，連下八百里文書，催要下文。 莫愁搭救湘云，私闖陳宅，被福康安擒拿，紀曉嵐借口自己與莫愁、湘云等俱是《石頭記》作者，必須共同合作，才能盡早把續書寫出，交太后的差。在皇帝近侍藍侍衛的陪同下，名正言順地解救了莫愁、湘云，并再次拿到了“紅樓”書稿。 紀曉嵐以一堆白紙偽稱書稿，交官差千里迢迢，進獻急不可待欲知下文的皇上及太后。陳未元對紀曉嵐恨之入骨，慫恿福康安在紀曉嵐裝訂書稿時來一個人臟俱獲。

和珅擔心張了了會牽連自己，便想用乾隆之手殺其滅口。紀曉嵐說出張了了是受人指使的真相，乾隆堅持給張了了定罪，關鍵時刻，小月趕到并拿出乾隆的扳指替張了了求情，乾隆成人之美，讓其與柳哥相聚。父女得以團聚。乾隆責怪和珅、紀曉嵐此行辦事不力，押送兩人坐囚車回京，以示懲罰。途中，二人依然針鋒相對，樂此不疲。瑤琴意識到乾隆身為一國之君，并不能給予自己想要的平靜生活，于是拒絕與乾隆一同回京，表示要與父親歸隱山野，乾隆無限失落。回京后，乾隆罰和珅、紀曉嵐掃地，兩人邊掃邊唇槍舌劍。乾隆暗得意，自知只有正邪共存，兩者相斗，自己才能享受安寧。"