戲園被圍，福康安領兵搜查后臺，紀曉嵐自言貪戀風情，才流連忘返，極力為莫愁、小月開脫罪名，且出謀劃策，鼓勵二人告倒贓官、為民伸冤，聽得與此案有干系的和與福康安是心驚肉跳。 四姑娘探知皇上要微服去燕城尋母，慫恿十四王爺借機取而代之；和等為自身利益謀，深怕失去對自己寵幸有加的保護傘，極力阻撓皇上出行。不想皇上尋母心切，哪里聽得進去。并邀小月、莫愁和紀曉嵐相伴，風塵仆仆直往燕城而去。一路所見，多是當地災民之慘狀，頗為痛心疾首。亦下定決心，要紀曉嵐查清事實，嚴加處置那些魚肉百姓的貪官污吏。 一行人初到燕城，與守城衛兵發生沖突，雙方大打出手，為免泄露身份，紀曉嵐與小月、莫愁與“許仙”各扮夫妻住進“天龍客棧”。客棧掌柜被蒙蔽，誤將他們認作是“軍機大臣和”。 和、福康安合謀利用十四王爺篡位之野心來轉移皇上的注意力。 莫愁無意間由“許仙”手中的一把折扇了解到眼前之人乃是九五之尊的當朝天子，不禁百感交集，日思夜想為民除害，未知一國之君近在眼前。

假戲真作，不如不作。既是三百里流放，皇上和兩個伴駕的臣子紀曉嵐、和便分別都有了一個綽號：金三爺、紀老大與和二。幾個人不問尊卑、素服簡出，為向哪個方向去，只好抓鬮決定，紀曉嵐作過手腳，眾人自然直奔曲陽。 “金三爺”不勝徒步奔波之勞苦，又饑又渴。“紀老大”卻頗會苦中求樂，最可憐的當屬“和二”，要忠心耿耿地伺候皇上，還得時不時領受紀曉嵐的挖苦。一路同行，笑話多多。終于在這夜半三更才投宿一家東升客棧。他們前腳剛至，小月與洪霞后腳便至。 直隸總督尚榮委派手下一一打點，皇上可能路經住宿的客棧。“金三爺”等三人一來，即被店家及尚榮的差役發現，不敢怠慢。連給他們各個所做的飯菜亦有等級差別。

紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

紀曉嵐探望戴沾。對證之下，兩人明白是和珅從中搗鬼使兩人頻生誤會。紀曉嵐表示如玉處境危險。為救如玉戴沾只得說出真相。得知如玉的真實身份，紀曉嵐驚訝萬分。如玉到獄中懇求戴沾與自己遠走高飛，戴沾卻表示要一心潛修《四庫全書》，不愿因為兒女情長而辜負顏驥厚望。得知乾隆早已知道自己的身份，如玉表示自己也早已忘記仇恨。紀曉嵐帶太后看戲，太后驚訝地發現公主為小月扮演，而駙馬正是如玉扮演。戲中駙馬原為女扮男裝，被發現后要處以死刑，太后深為同情女駙馬，令紀曉嵐修改劇本，恕女駙馬無罪。

軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"