毛利小五郎受久須美工械廠社長的委托，調查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對職員們暗中調查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對象，三人計劃在倉庫抓住罪犯的現行，不料卻發現谷崎死在了反鎖的房間里。正當案件一籌莫展時，谷崎生前研究的老鼠機器人引起了柯南的注意。

找到失蹤的貓咪后小五郎和柯南拿著酬勞準備去吃飯，但他們卻突然聽到尖叫的聲音，在樓下他們發現一對夫妻死在了家里。死在客廳里的是身中數刀的前原圣一，而他的妻子前原早紀則被捆綁在臥室的衣櫥里窒息死亡。警方探查之后認為殺死圣一的正是他的妻子早紀，想要掩人耳目而把自己捆起來關入衣櫥的早紀卻遇到了意外，但真相真是這樣嗎？

唐三帶著小舞急匆匆趕回學苑，準備參加下午的魂師會長競選大會，小舞信心滿滿，沒想到競選大會早已經結束了，蕭塵宇仗著人多勢眾當選了魂師會會長，還給附課生準備了一份課程表，上午干活，下午還要工作，不但沒有時間上課，就連魂力訓練也不能參加，根本不可能提升武魂，蕭塵宇擺明就是針對唐三和小舞，王圣忍不住替唐三打抱不平，勸他們倆趁早逃走，因為諾丁城和學苑都是蕭氏家族的。唐三無意中發現城主府的魂師凌風派人抬著一個笨重的鐵籠子來到學苑，柳龍把他們帶到后院一間空房子里。唐三滿腹疑慮，就用意念召喚藍銀草，想進去一看究竟，可唐三連試了幾次都不成功，他穩定心神讓自己靜下心來，藍銀草越長越大，他借助藤蔓爬上房頂，看到鐵籠子里是一只幽冥狼，那是凌風抓來的，蕭塵宇拔劍殺死了這只狼，鐵籠子上方出現一圈白色的魂環，蕭塵宇把魂環緊緊握在手心里，他瞬間成為真正的魂師，揚言要和唐三決一死戰。唐三連夜去找玉小剛請教，玉小剛勸他趁早放棄，蕭塵宇想要的是小舞，唐三不服氣，玉小剛答應幫他獲得魂環，讓他今晚準時來見面。深夜時分，唐三看到小舞已經熟睡，就匆匆趕來見玉小剛，玉小剛要帶他去獵獸森林打魂獸得魂環，可是需要武魂殿的通關手令才能進森

米小圈在電視上看到小區大娘的寵物狗丟了，看來小區附近有偷狗賊，米小圈非常驚慌地跑出去看耗子，剛好姜小牙也在，姜小牙總是來看耗子，現在不會再偷偷將它帶回家了，鐵頭也看了電視，匆匆忙忙來找耗子，三個人都這么關心寵物狗，鐵頭聽到米小圈同意他作孩子的哥哥，起初還很開心，當聽到姜小牙和米小圈都作了耗子的爸爸時，頓時不開心了，三個人的關系這么鐵，現在直接差輩了。三個人正說著，忽然發現狗沒了，之后匆匆忙忙去找狗，卻在小區另一側，中央公園門口一個老大爺騎車帶著耗子悠閑而去。米小圈和姜小牙鐵頭就這樣看著耗子被帶走，他們立刻給警察叔叔報了警，之后尾隨狗販子看要將狗帶去哪里。他們一路跟著到了一處小院，親眼看到耗子被關了進去，米小圈和姜小牙和鐵頭商量采用聲東擊西的方法引開爺爺，之后再偷偷潛入院子將耗子偷走。鐵頭哭不出來，姜小牙便幫忙在他大腿處狠狠掐了一把，終于鐵頭疼得哇哇大哭。鐵頭哭著稱自己找不到家，老大爺便帶著他去找家，米小圈和姜小牙便悄悄溜進院子，將耗子給抱了起來，姜小牙被一盆粉紅色的面團吸引，伸手去捏了捏，竟然整雙手都被陷了過去，米小圈趕過去幫忙，兩人都被面團黏住了。就這樣錯過了偷跑的最佳時機，不一會兒

不分晝夜騎著巨大摩托車四處游蕩的天城達也遇害，生前給周圍居民帶來不小困擾的他遭到了人們的冷漠對待，大家都很慶幸有人殺了他。應當擔任與天城達也溝通協商的居委會會長番藤彥一死在了自己的家中，雖然現場布置成了自殺的模樣，但柯南和小五郎還是看出了端倪，這一點被咖啡廳的老板金滿豐子證實，她提出昨晚番藤根本就不會與天城見面。