電視臺(tái)要制作與小五郎24小時(shí)密切接觸的電視節(jié)目，為了討論節(jié)目?jī)?nèi)容，小五郎帶著柯南和小蘭隨節(jié)目制作公司的社長(zhǎng)染井彰吾一起前往東都電視臺(tái)制作人中目賴(lài)策的家中商討方案，沒(méi)想到大門(mén)竟然上了鎖而且按門(mén)鈴也沒(méi)有回應(yīng)，于是請(qǐng)來(lái)管理員打開(kāi)門(mén)進(jìn)入公寓，出現(xiàn)在他們眼前的是因喝下毒咖啡而身亡的中目的尸體，從在桌面和地面上打翻的咖啡痕跡，柯南看出這是一起密室殺人案。

這天小五郎和柯南看到警車(chē)駛過(guò)，便和目暮警官一同趕往殺人現(xiàn)場(chǎng)。原來(lái)是公寓的某屋內(nèi)發(fā)現(xiàn)了小說(shuō)家齊川村子的尸體。死因是頭部被物品打擊致死。發(fā)現(xiàn)尸體的是迷宮出版社的編輯遠(yuǎn)野舜一和公寓管理員村田啟三。遠(yuǎn)野說(shuō)齊川之前收到了恐嚇的明信片。而在警方的調(diào)查下柯南最終發(fā)現(xiàn)了犯人的真面目。

根據(jù)紙飛機(jī)上的圖案，柯南和沖矢幾乎在同一時(shí)間明白這是急救用的摩斯密碼，而投紙飛機(jī)的人想傳達(dá)的則是緊急求救的信息，之后，小蘭將其他兩只紙飛機(jī)發(fā)到新一的手機(jī)上，將這三個(gè)帶有暗號(hào)的紙飛機(jī)串聯(lián)在一起，新一推斷出被綁架的人就是電視上成日?qǐng)?bào)道的代田社長(zhǎng)以及他所在的地點(diǎn)，得知這些以后，小蘭不顧自己的安危沖進(jìn)了綁匪的據(jù)點(diǎn)。

和葉的風(fēng)車(chē)給了服部提示，同時(shí)柯南也知道了房屋血跡和尸體消失的手法，在否定小五郎異想天開(kāi)的推測(cè)后，服部說(shuō)出了真相并且指出在背后操作的人正是住持傳久的師父，然而他這么做的目的到底是什么？了結(jié)了升岳寺案件后，小五郎連夜驅(qū)車(chē)返回住處，次日，服部要去參加日賣(mài)電視臺(tái)在一座無(wú)人島舉辦的高中生推理大賽，柯南也隨他一同前往，沒(méi)想竟然在這里遇見(jiàn)了白馬探！

東西南北四個(gè)代表簡(jiǎn)單做了自我介紹以后，就各自回房休息，吃飯的時(shí)候卻發(fā)現(xiàn)導(dǎo)播被人綁在形如密室的房間內(nèi)，所幸生命沒(méi)有受到威脅，就在大伙兒忙著尋找線(xiàn)索時(shí)，照顧他們起居的甲谷突然說(shuō)這是比賽的第一題，北部代表越水七規(guī)承諾一小時(shí)之后就能重現(xiàn)密室手法，等待期間南部代表時(shí)津潤(rùn)哉說(shuō)起了一年前的薰衣草殺人事件。時(shí)間一點(diǎn)點(diǎn)過(guò)去，越水遲遲不現(xiàn)身，待大家趕到時(shí)，他已死在了密室中。