聽到都禮所說的秦廣大王的罪行后，石敢當決定親自去質問秦廣大王身為神仙，為何要危害百姓。石敢當化成都禮的樣子去一間廟中找秦廣大王，一進來秦廣大王便問他是否拿到了祭品，沒想到秦廣大王竟然真的指使屬下去做迫害百姓之事，石敢當現出原形要打他，秦廣大王趕緊攔住石敢當，并將自己不得不這樣做的緣由告訴他。冥界被妖魔占領，神仙們都被奎剛擄走，只有他逃出了冥界來到人間。奎剛把冥界里的厲鬼都放了出來禍害人間，沒了地府供給的營養，厲鬼們甚至闖入百姓家中吃人，秦廣大王表示自己費了很大的力氣才把厲鬼們聚集在一起，從地府被逼來陽界的他沒辦法只好想出讓都禮去找血食祭品給厲鬼們供給營養的方法。結合秦廣大王的話，石敢當突然想起來黑蓮圣使曽說過玉帝駕崩，天庭由奎剛掌管的話。石敢當意識到天界可能真由奎剛霸占了，他所看到的一派祥和的天庭應該是奎剛制作出來的幻境。晚上石敢當身上的金丹顯了光，太上老君就在金丹里，他告誡石敢當相信自己所看到的。石敢當與朱半斤來到雙塔縣城，他們進入城中，卻發現城里一個人都沒有。二人進入雙塔寺，寺中全是和尚們的尸體，突然畫面一轉他們來到了天庭，師父楊戩問他們為何不繼續尋找凡間奎剛的法身，反而回到了天庭

石敢當跌落了人間，掉在了村子里面的柴火堆中。村民看到了石敢當奇怪的樣子，以為他是妖怪，嚇得尖叫了起來。村子里面的人都以為石敢當是妖怪，拿著棍棒打了石敢當一頓，石敢當逃跑到了鎮子上，攤販都覺得石敢當是妖怪。石敢當的背后長著羽毛，卻覺得自己是人。衙役見到了石敢當身上有羽毛，于是把石敢當當成妖怪給抓了起來。石敢當說自己并不是故意偷東西的，自己只是因為太餓了所以才拿了攤子上的炸豆腐吃。縣令董森見到了石敢當的樣子，于是命令人把石敢當給抓了起來，獻給了皇帝。皇帝從術士那里得知，石敢當這種石精很適合做長生不老藥的藥引子，皇帝一開始覺得不忍心，但是想到石敢當是個妖怪，于是同意了。術士試圖逼迫石敢當現出原形，但是石敢當并沒有顯形。術士決定把石敢當給放進煉丹爐里面，并且堅持聲稱石敢當就是妖怪。石敢當被爐火煉化以后居然還是原來的樣子，這讓術士大吃一驚 。術士隨后決定把石敢當的腦袋砍下來，看看這次石敢當能不能現出原形。石敢當掙脫了束縛，并且飛到了天上，兩翼發出金光，皇帝大吃一驚，這才明白自己誤會了石敢當，他并不是妖怪。楊戩開始有所懷疑，自己當天在泰山見到了原力非常之大，應該不是蜃幻化成型的元神。首陽山上忽然出

石敢當與敖申決定先去鹿兒家休息一晚，隔天再起早去救半斤與玉蓮。鹿兒把二人帶回家并為他倆做了參雞湯，石敢當問鹿兒是否知道軒轅洞的具體位置，鹿兒當即搖頭表示自己不知，隨后石敢當與敖申覺得身體有些不適，原來這個鹿兒是巨蝎假扮的。巨蝎現出原形并諷刺石敢當與敖申愚蠢，蜃也來到此地打算殺死二人，殊不知石敢當與敖申根本沒有上巨蝎的當。石敢當早在下午救下假鹿兒時便識破了巨蝎的詭計，他將計就計只為救出真鹿兒，巨蝎與蜃本以為此次能殺害石敢當一行人，沒想到反被石敢當所傷，蜃與巨蝎只好趕緊逃走。石敢當與敖申在樹林里救出被綁的真鹿兒，鹿兒趕緊將二人帶回家中休息，石敢當向她提起軒轅洞的事情，鹿兒表示自己自幼便生活在昆侖山，她明天可以為二人引路。石敢當與敖申打算進入軒轅洞去取盤古開天鉞與天鏡盾，鹿兒告訴他們守在軒轅洞門口的是一個名叫三頭雷的怪物，三頭雷有三個獅頭，連神仙都治不了它，但它酷愛人參，他們可以拿人參吸引三頭雷的注意力，再利用隱身草進入軒轅洞。隔天鹿兒將他們帶到了軒轅洞門口，石敢當與敖申利用鹿兒教給他們的方法成功進入軒轅洞并取出了盤古開天鉞與天鏡盾，出來時他們險些被三頭雷發現，多虧鹿兒提醒他們利用隱身草才逃

李衙內把朱玉蓮給抓了起來，朱玉蓮死活不從。朱半斤和石敢當兩個人趁著夜色來到了李衙內的房子外面，石敢當膽子小不敢進去，朱半斤于是決定自己引開李衙內，讓石敢當趁機把朱玉蓮給救出去。朱半斤扮成了送酒的小廝，自己接著送酒的機會引開了李衙內。眼見得李衙內就追出來了，石敢當連忙帶著朱玉蓮逃走，并且把朱半斤也給救了出來。三個人逃走以后，朱玉蓮對朱半斤發了一通火，認為當天都是朱半斤惹出來的禍端，這讓朱半斤覺得很是委屈。李衙內因為美人兒被搶走了大為惱火，帶著手下來到了朱半斤的家里。朱玉蓮告訴石敢當，雖然有著一顆善良之心，但是即使如此，面對惡人也是應該出手的，不能做一味善良的東郭先生。聽到這里，石敢當若有所悟。半夜李衙內殺到了朱半斤的家里，石敢當面對此情此景終于出手，奪回來了玉蓮，說自己絕對不做東郭先生。朱半斤當即上去把李衙內給痛打了一頓。李衙內丟了美人又丟了臉面，于是聽了手下的建議，來到云霧山上，獻上了祭品希望豹子大王能幫自己做一件事情。李衙內帶來了成箱的金銀珠寶，希望豹子大王幫自己把朱家的男人都給殺死了，把美人兒給自己留下。豹子大王見財起意，當即答應了下來。半夜的時候豹子精帶著手下沖進了朱家，把石敢當

三百年后，劫數一到，奎剛便聚集眾妖準備殺入三界奪取天庭。一條巨蟒在冥界作亂，它害得投胎之鬼出不去，陽間魂魄進不來，秦廣大王趕緊一探究竟，發現確是一條巨蟒在作亂，還留下三界浩劫，無人能逃的字樣。天庭的蟠桃突然一夜之間枯爛壞死，桃樹全都連根腐爛且之前查不出任何異象，在臨近蟠桃大會之際發生這樣的事情，玉帝打算不舉行蟠桃盛會。其中一名神仙表示蟠桃大會是歷年盛會，如果不辦會使天界不安，現在蟠桃突然一夜枯爛，只能拿太上道祖的仙丹舉辦一個丹元盛會，玉帝點頭應允。重華宮關著的妖怪突然發出巨大的聲響，結合近日天庭的一幢幢怪事，玉帝意識到是劫數到了。黑袍護法帶著眾妖殺入天庭，玉帝勸眾神不要與妖怪們戰斗，既然是劫數就不能躲，自會有人幫助他們渡過難關。奎剛進入凌霄殿，有兩位神仙擋住他的去路，奎剛穿過他們的身體，之后兩位神仙便化作齏粉而死。玉帝深知這是劫數躲不過，他當著大家的面放棄玉帝之位，入釋凡家。太上老君也意識到劫數的來臨，他囑咐弟子之后他會化成一粒清丹，讓弟子把清丹交給武圣石敢當。奎剛來找太上老君，他勸太上老君歸服于他，太上老君不肯，之后化成一粒清丹，等奎剛走后，太上老君的弟子出來撿起清丹，他趕緊想辦法逃