毛利小五郎受久須美工械廠社長的委托，調查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對職員們暗中調查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對象，三人計劃在倉庫抓住罪犯的現行，不料卻發現谷崎死在了反鎖的房間里。正當案件一籌莫展時，谷崎生前研究的老鼠機器人引起了柯南的注意。

在幫純子小姐調查入室偷竊的時候小五郎和柯南遇到了一起命案，死者是純子小姐的鄰居北上先生，初步判斷為酗酒墜樓，但在高木警官調查附近鄰居時柯南看出了端倪。所調查的房間里柯南看到了幾處線索，這些都可以說明北上并非意外墜亡，但是柯南還是沒有找到關鍵的證據，小五郎在電梯里整理儀容時柯南突然明白了什么。

柯南等人來到方斗寺調查會預知未來的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內留宿。正當眾人享用晚飯時，突然從房內傳出一聲慘叫，原來是正在房中念經的住持被人殺害。毛利小五郎通過柯南在院內找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當兇手跪地坦白自己的罪行時，柯南突然發現案件并沒有結束……

唐三帶著小舞急匆匆趕回學苑，準備參加下午的魂師會長競選大會，小舞信心滿滿，沒想到競選大會早已經結束了，蕭塵宇仗著人多勢眾當選了魂師會會長，還給附課生準備了一份課程表，上午干活，下午還要工作，不但沒有時間上課，就連魂力訓練也不能參加，根本不可能提升武魂，蕭塵宇擺明就是針對唐三和小舞，王圣忍不住替唐三打抱不平，勸他們倆趁早逃走，因為諾丁城和學苑都是蕭氏家族的。唐三無意中發現城主府的魂師凌風派人抬著一個笨重的鐵籠子來到學苑，柳龍把他們帶到后院一間空房子里。唐三滿腹疑慮，就用意念召喚藍銀草，想進去一看究竟，可唐三連試了幾次都不成功，他穩定心神讓自己靜下心來，藍銀草越長越大，他借助藤蔓爬上房頂，看到鐵籠子里是一只幽冥狼，那是凌風抓來的，蕭塵宇拔劍殺死了這只狼，鐵籠子上方出現一圈白色的魂環，蕭塵宇把魂環緊緊握在手心里，他瞬間成為真正的魂師，揚言要和唐三決一死戰。唐三連夜去找玉小剛請教，玉小剛勸他趁早放棄，蕭塵宇想要的是小舞，唐三不服氣，玉小剛答應幫他獲得魂環，讓他今晚準時來見面。深夜時分，唐三看到小舞已經熟睡，就匆匆趕來見玉小剛，玉小剛要帶他去獵獸森林打魂獸得魂環，可是需要武魂殿的通關手令才能進森

小五郎受J聯賽之邀擔任東京SPIRITS隊和大阪鋼巴隊的比賽開球儀式嘉賓，柯南與小哀他們也跟著小五郎來參觀后臺。步美是東京SPIRITS隊11號赤木英雄球員的粉絲，這次是英雄受傷后的首次出賽，步美本想送自制飲料給英雄，但因規定只能將賽場提供的運動飲料遞給了英雄。小五郎見狀也要了一瓶飲料解渴，但卻沒想到因此引發了不良反應。