柯南和小五郎看到和果子店老板娘相川與警察發(fā)生爭(zhēng)吵，詢(xún)問(wèn)得知，住在這棟公寓的小澤死亡，相川說(shuō)她曾看到一名男子出入小澤家，因此認(rèn)為小澤是他殺，然而從對(duì)現(xiàn)場(chǎng)的勘察來(lái)說(shuō)，警察認(rèn)為是自殺，于是，小五郎和柯南介入調(diào)查，并且警方還叫來(lái)了相川口中的殺人犯清水，雖然清水有足夠的不在場(chǎng)證明，但相川卻堅(jiān)持認(rèn)為兇手就是清水，這兩人之中，一定有人在說(shuō)謊！

因接到電視臺(tái)的邀請(qǐng)，小五郎便帶著柯南和小蘭飛到?jīng)_繩，參加一個(gè)與職棒選手能勢(shì)和主持人本山對(duì)談的節(jié)目錄制。在機(jī)場(chǎng)與本山會(huì)合之后，一行人打算去能勢(shì)下榻的酒店接他，沒(méi)想到卻在半路發(fā)現(xiàn)了能勢(shì)的尸體，期間，本山的一句話讓柯南認(rèn)定他就是兇手，可能勢(shì)死亡的時(shí)候，他正在飛機(jī)上，因此有充分的不在場(chǎng)證明，那么，他到底是如何往返于兩個(gè)地方犯案的？

當(dāng)小五郎準(zhǔn)備再度去詢(xún)問(wèn)南里薰，卻在門(mén)外聽(tīng)到她的慘叫，還不等小五郎沖進(jìn)去，就從屋子里匆忙跑出了一個(gè)男子，幸運(yùn)的是南里薰并沒(méi)有被殺害，醒來(lái)之后，南里薰說(shuō)起了自己突然消失的男朋友安西，從小五郎的照片上可以看出，這個(gè)人也曾出現(xiàn)在米花飯店，這些原本不相識(shí)的人，因?yàn)檫@件古怪的命案被聯(lián)系了起來(lái)，柯南將安西、南里薰和美奈子一起找來(lái)，這兩起經(jīng)過(guò)完美設(shè)計(jì)的命案，即將真相大白！

與黑衣組織的戰(zhàn)斗告一段落，又回到了平靜的生活。某天，少年偵探隊(duì)獲知同樣就讀帝丹小學(xué)的雨宮翔子突然消失，據(jù)說(shuō)她和灰原十分相像，莫非黑衣組織的魔爪已經(jīng)深入學(xué)校？為找到翔子，放學(xué)后大家展開(kāi)了調(diào)查，期間還遇到神色可疑的老師，之后一行人找到了翔子失蹤前來(lái)過(guò)的便利店，并得知她在這里買(mǎi)了飲料、牛奶和小刀片，就在柯南他們百思不得解時(shí)，由美出現(xiàn)……

柯南、步美等人在阿笠博士的帶領(lǐng)下，來(lái)到假面超人的拍攝現(xiàn)場(chǎng)，不巧正好碰上攝制組休息，在這期間不時(shí)能聽(tīng)到陣陣的爭(zhēng)吵聲，劇組工作人員深町堅(jiān)決反對(duì)特效演員力石表演危險(xiǎn)動(dòng)作，可是力石卻倔強(qiáng)的想要證實(shí)自己的實(shí)力，結(jié)果在表演中發(fā)生了意外，他的車(chē)子沖破柵欄從樓頂摔了下來(lái)，力石當(dāng)場(chǎng)死亡，當(dāng)所有人都為這場(chǎng)意外感到惋惜時(shí)，柯南卻看出了這是巧妙布局的殺人事件。