在咖啡廳進(jìn)行調(diào)查的時(shí)候，柯南提醒警方和小五郎，他們?cè)姷降木脼|或許并不是她本人，這時(shí)，莊堂提議帶他們?nèi)ゾ脼|買洋裝的服裝店，并證實(shí)了久瀨一個(gè)人來(lái)買衣服的事實(shí)，加之在咖啡廳打碎的杯子上檢測(cè)到久瀨的指紋，這些無(wú)疑都成了莊堂無(wú)法犯案的證明，然而，不論計(jì)劃多么嚴(yán)密，都無(wú)法瞞過(guò)柯南的眼睛，他將喋喋不休的小五郎麻醉并躲在柜臺(tái)后面道出了真相。

阿笠博士的金龜車在半路拋錨，導(dǎo)致他和灰原只能在路邊等便車，碰巧這時(shí)來(lái)了一輛前往東京的車子，車主是一對(duì)古怪的情侶，并且灰原還在車內(nèi)發(fā)現(xiàn)了彈孔和血跡，更恐怖的是她聽到這對(duì)情侶說(shuō)要找到柯南把他弄個(gè)半死之類的話，驚恐的灰原趁機(jī)打電話向柯南求救，沒想到一直按照柯南指示的她竟然被這對(duì)情侶抓個(gè)正著，這兩個(gè)人是黑暗組織成員嗎？柯南又是出于什么原因讓灰原和博士乖乖被抓？

妖怪倉(cāng)庫(kù)是把貴重的物品放進(jìn)里面就會(huì)立刻消失的倉(cāng)庫(kù)，少年偵探團(tuán)為了弄清真相決定一探究竟，元太他們?yōu)榱俗尶履下冻鰺o(wú)話可說(shuō)的表情而干勁滿滿。在調(diào)查了倉(cāng)庫(kù)內(nèi)部之后，柯南只看到了地板上留下的零星腳印和嵌在墻上的大算盤，除此之外別無(wú)他物。但從外面的天窗向里面看的話，就能看到堆積如山的寶物，可意外的是當(dāng)再次打開倉(cāng)庫(kù)的門時(shí)，里面的寶物就全都消失不見，柯南提出的天花板和地板機(jī)關(guān)的猜想被光彥等人否認(rèn)，難道妖怪倉(cāng)庫(kù)真的存在？

連續(xù)三年都會(huì)在生日時(shí)會(huì)收到恐嚇信的保科琉璍子，為了今年的生日會(huì)能夠順利舉行而邀請(qǐng)毛利作為保鏢。來(lái)到保科宅邸的小五郎眾人發(fā)現(xiàn)屋子里有著眾多的時(shí)鐘，而對(duì)于時(shí)鐘的準(zhǔn)時(shí)性屋子的主任琉璍子也似乎有著非常人的執(zhí)著。在參觀屋子的時(shí)候柯南眾人還得知了屋子以前發(fā)生的事故，就在生日宴會(huì)中剛剛吹熄蠟燭的琉璍子突然被刺身亡！

柯南和服部等人得知了犬伏家兄妹幾人改名的事情，而在和葉子和小蘭的閑聊中服部和柯南領(lǐng)悟到了魔犬的秘密正在這時(shí)裟臣婆婆卻突然倒下。而在小蘭和葉子的提示下小五郎推理出幸姬變是此次事件的犯人。而當(dāng)眾人來(lái)到小屋里尋找幸姬的時(shí)候，魔犬卻突然出現(xiàn)！但當(dāng)魔犬撲過(guò)來(lái)時(shí)眾人發(fā)現(xiàn)魔犬其實(shí)只是小狗，而服部和柯南也揭露了犯人的真面目。