死者被殺時手里握著剪刀，尸體的傷口處還粘滿了蜂蜜，不僅如此，案發現場的水龍頭還一直開著，柯南和昴確定兇手就是零食店的仙波先生，但他們還一時半會兒找不到兇器。在詢問了保鏢后柯南有了一些線索，阿笠博士在院子里看到的成群螞蟻也為他們提供了幫助，兇手到底是運用了什么手法來作案的呢？

阿笠博士帶著少年偵探團去朋友家的別墅玩，眾人卻在別墅的院子里發現一名倒在血泊中的男子，經證實此人正是俗稱“佐羅”的連環搶劫縱火犯的同黨伊勢原祐二。為了解開謎團，柯南只身一人前往深山，目睹了佐羅意圖殺害伊勢的場面。想要解圍的柯南在和伊勢一起逃亡的過程中被逼上了臨海的懸崖，在佐羅的追殺中不慎墜落懸崖的二人命運將會如何？

這天，米小圈的班級來了模范英雄，英雄講完他小時候實現夢想的艱辛，問同學們有什么夢想，米小圈的同學各抒己見，有愿望當人民教師的，有夢想當科學家為人類做貢獻的，當提問到米小圈，他早就想好了，人生最大的愿望就是當一個賣冰棍的老奶奶，米小圈的愿望一說，全班同學哄堂大笑，米小圈窘得兩個小臉蛋通紅通紅的。回到家，他依然愁眉不展，媽媽建議他作一名老師也好，米小圈卻心悸地說萬一李琳當上了教研組組長，今后還得歸李琳管，媽媽又接著給他出主意當一名白衣天使，米小圈也害怕從小就歸老媽管，真的不敢長大了還跟老媽在一個醫院，實在太痛苦了。米小圈的父親給他出主意，可以當一名畫家，今后名利雙收，有無數的粉絲紛紛朝他蜂擁，為他喝彩。父親的動人演講深深打動了米小圈，他當即決定，自己今后要當一名畫家。很快，父親便給他安排到繪畫班學習畫畫。第一次來到繪畫班，米小圈便被梵高的自畫像給迷住了，這個赫赫有名的畫家哪里都正常，唯獨少了一個耳朵，旁邊的同學故意嚇唬他，梵高就是割了一只耳朵才聞名世界，原來要出名必須少一個耳朵，米小圈有些觸目驚心，心里開始打退堂鼓，美術老師終于出現了，米小圈驚訝地看到老師也將其中一個耳朵打上繃帶，簡直和畫

一直被大家遺忘在家中的狗引起了柯南與平次的注意，二人很快就洞察了這一系列殺人事件的作案手段。平次委托村長告訴眾人他已經得知了鵺的真面目，并在庭院內為眾人重新演示了一遍案發當日的情形。在二人的推理下真相終于浮出水面，兇手成功被警方抓獲。當案件塵埃落定后，平次終于鼓起勇氣準備向和葉告白……

利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？